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对生物信息学的展望

有人说,基于序列的生物学时代已经到来,尽管对此说法可能有所争议,但是今日像洪水般涌现的序列信  (本文共1页) 阅读全文>>

内蒙古农业大学
内蒙古农业大学

内蒙古白绒山羊HGT序列及结构的特征分析

内蒙古白绒山羊是一种优良家畜品种,通过EST(表达序列标签)测序在分子水平上获得大量数据,这些数据提供了内蒙古白绒山羊的部分基因信息,为进一步研究与山羊绒生长相关基因奠定基础。本实验选择内蒙古白绒山羊毛囊兴盛期cDNA文库为研究材料,其中15条HGT (高甘氨酸/酪氨酸角蛋白关联蛋白)的cDNA序列已被国际公共数据库—GenBank数据库接受,其中KRTAP6(角蛋白关联蛋白家族6)家族成员6个,KRTAP7家族成员1个,KRTAP8家族成员2个,KRTAP16成员6个。通过对不同物种HGT氨基酸序列的比较分析,发现山羊HGT的氨基酸序列与其它哺乳动物如人、小鼠和绵羊的HGT氨基酸序列有很多一致或保守的区域。分析其蛋白功能位点,发现在山羊的HGT中有许多豆蔻酰化位点。通过对白绒山羊HGT蛋白的二级结构预测,发现绒山羊HGT和其它物种HGT的二级结构中无规则线性长链结构所占比例最多,β-伸展结构占到了较少的部分,几乎没有发现α-螺...  (本文共55页) 本文目录 | 阅读全文>>

吉林大学
吉林大学

基于R语言的差异表达基因检测研究

21世纪,在这个信息社会,同时也是生命科学的时代,生物信息学已经成为一门新兴的学科。生物信息学作为多学科交叉的产物,包括生物学、计算机科学、数学、物理学以及信息科学等很多领域,通过互联网为媒介,以数据库为载体,数学理论知识来建立各种计算机模型,对实验生物学中产生的海量生物学数据进行处理、存储、检索以及分析和解释其生物学含义。本文主要探讨学习使用生物信息学的工具R语言以及Bioconductor生物信息学软件集,解决生物信息学的问题,通过T统计方法探讨了R语言在生物信息学差异表达基因检测中的应用。R语言是通过图形显示和统计计算为基础的开放式的软件平台,是一种通用的计算机语言。R语言在生物信息学中开发出了面向特定应用的软件,Bioconductor就是R语言开发的生物信息学中面向基因组信息分析的应用软件集合。R语言作为进行绘图、统计分析的语言,因为其开源性、可移植性、灵活性,而在统计、生物等学科领域有着广泛的应用。在生物学领域中,尤...  (本文共49页) 本文目录 | 阅读全文>>

江南大学
江南大学

基于SAS系统的基因序列模型分析

生物信息学是用数理和信息科学的观点、理论和方法,以计算机为工具对生物信息进行获取、处理、存储、分配、分析和解释的一门学科,它是数学、生物学、医药学、计算机科学和物理学等学科的有机结合。SAS系统作为数理统计中的重要方法,在生物信息学中同样有着巨大的作用,其中聚类分析法,判别分析法,主成分分析法以及时间序列模型等越来越广泛的运用到生物信息学中,为研究生物信息学问题提供了更广泛的方法与思路。本文的主要工作包括以下几个方面:1、根据木聚糖酶分子的进化情况,以木聚糖酶分子中的几种重要的氨基酸含量为变量,设计一个时间序列的实验,并利用ARIMA模型进行了氨基酸含量的分析与预测,详细说明了建模的步骤,并介绍了建模的前提条件与参数选择,得到了所选择的氨基酸的进化趋势图,通过对图形的分析来说明其含量在各个进化阶段的变化,得出木聚糖酶两家族的进化稳定性特征以及甘氨酸在两家族进化过程中的差异。由此结果可推广到研究两家族同义密码子的偏好性问题。2、利...  (本文共49页) 本文目录 | 阅读全文>>

《中国科技信息》2010年22期
中国科技信息

基于生物信息学数据库的研究与应用

随着生物信息学的发展,生物信息数据库日趋完善。本文阐述了生物信息学数据库在生物信息学的发...  (本文共2页) 阅读全文>>

《科技咨询导报》2007年03期
科技咨询导报

我国生物信息学的现状与展望

随着人类基因组计划的启动,生物信息学作为一门计算机处理生物数据的交叉学科发展起来了,...  (本文共1页) 阅读全文>>