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肝脏蛋白质相互作用图绘出

本报讯 (通讯员甄 蓓 特约记者吴志军)军事医学科学院放射与辐射医学研究所、蛋白质组学国家重点实验室杨晓明研究员和贺福初院士所领导的科研团队,联合复旦大学、湖北大学等单位,成功绘制出人类肝脏蛋白质相互作用网络连锁图。相关论文10月11日发表在最新一期《分子系统生物学》杂志上。该论文阐释了目前世界上最大的人类器官蛋白质相互作用网络连锁图框架,标志着由中国科学家在国际上率先提出的“人类肝脏蛋白质组计划”研究又取得重要进展。$$    全景式研究蛋白质相互作用而得...  (本文共1页) 阅读全文>>

权威出处: 健康报2011-10-27
《首都医科大学学报》2013年03期
首都医科大学学报

通过液质联用鉴定蛋白质相互作用方法的建立

蛋白质是生命功能的执行者,但大多数蛋白质并不能单独行使其功能,而是通过与其他蛋白质相互作用来参与细胞或组织的生理活动[1]。蛋白质组学研究的轰轰烈烈兴起开启了人们解析各种生命活动以及生理功能的新思路,近些年已经由比较蛋白质组学研究逐渐过渡到功能蛋白质组学研究。构建蛋白质相互作用网络能展示出两种以上蛋白质之间的相互依赖性以及这些蛋白质相互作用所起到的重要生理功能[2]。对于蛋白质相互作用研究的方法不断涌现,有蛋白芯片技术,X-射线晶体学技术、酵母双杂交、带标签-pulldown技术、免疫共沉淀技术、多肽阵列技术以及荧光显微镜技术[3]。首都医科大学医学实验与测试中心蛋白质组学研究测试室已经开展将pull-down或免疫共沉淀之后的样品再经液质联用来鉴定相互作用的蛋白,本文介绍一种通过谷胱甘肽-s-转移酶(glutathione S-transferase,GST)-pull down技术寻找大鼠肾组织中与诱饵蛋白相互作用的蛋白,再...  (本文共5页) 阅读全文>>

《中国分子心脏病学杂志》2008年02期
中国分子心脏病学杂志

蛋白质与蛋白质相互作用研究技术

蛋白质间相互作用是细胞各种基本功能的主要完成者,参与几乎所有的重要生命活动。因此,蛋白质一蛋白质相互作用研究以及建立相互作用关系的网络图,具有十分重要的意义,也是目前蛋白质研究领域的热点。如何能高通量、大规模地筛选相互作用的蛋白质,从而绘制出蛋白质相互作用图谱,帮助我们了解这些蛋白质的功能,给实验技术提出巨大挑战,从而促进蛋白质一蛋白质相互作用技术的进步和完善[‘]。1酵母双杂交系统(The two一hybrid system 1.1酵母双杂交系统的原理:酵母双杂交系统由st耐叮Fielas和oK一k列song等人[’]基于对酵母转录因子GAIA的认识,在研究真核基因转录调控中创建的一种分子生物学方法。GAM由结构上可以分开、功能上相互依赖的2个结构域组成:位于N端DNA结合域(DNA binding domain,DNA一BD)和位于C端转录激活域(Aetivati。。dom苗n,DAN一AD)。DNA一BD或AD单独作用不能...  (本文共5页) 阅读全文>>

上海大学
上海大学

蛋白质相互作用网络的数值研究

随着人类基因组测序工作的初步完成,生物信息学这一新兴交叉学科得以孕育和发展,并成为生物学、计算机科学及应用数学等多种学科研究的热点和重大前沿领域之一,也是21世纪自然科学的核心领域之一。“后基因组时代”面临的更多挑战来自于对蛋白质组学的研究,这是因为蛋白质组学能更为深入地揭示生命现象的本质,从蛋白的相互作用关系与功能上回答生命过程的规律,而目前人们对它还缺乏有效的研究手段。本论文将计算机科学应用于蛋白质组学,以生物信息学的方法研究蛋白质的相互作用网络。本论文以蛋白质相互作用网络为对象,在基于Web Service的生物信息学问题求解平台PSE-BioServer上,以跨物种网络搜索的方法,研究了酵母、果蝇和人类等不同物种间蛋白质相互作用网络的相似性,以认知蛋白质相互作用的意义,预测蛋白质的功能和相互作用,获取生物进化过程中的保守信息,并将相似网络中反映的信息作为进一步研究和治疗疾病的参考。本论文的创新性工作主要有四个方面:(一)...  (本文共148页) 本文目录 | 阅读全文>>

国防科学技术大学
国防科学技术大学

基于谱方法的蛋白质相互作用网络分析

人类基因组及多种模式生物测序项目完成后,生物信息学的研究也随之步入后基因时代。后基因时代的热点研究领域之一是蛋白质组学。其中,蛋白质相互作用网络又是蛋白质组学研究中的重点。蛋白质相互作用网络分析对蛋白质组学的研究乃至人类疾病的研究都具有重要的意义,同时也将为后基因时代蛋白质组学领域的其他研究提供一个基础性的理论参照。本文在总结现有蛋白质相互作用网络分析方法的基础上,针对挖掘和发现蛋白质相互作用网络中的典型特征模式和社团结构模块问题进行了深入研究,改进了现有分析方法,提出了新的评价指标,并进行了实验验证。论文主要工作如下:(1)总结了现有蛋白质相互作用网络分析的方法和技术。系统分析了蛋白质相互作用网络分析的研究现状,归纳总结了当前蛋白质相互作用网络分析所面临的困难和挑战,据此给出了本论文的研究内容。(2)蛋白质相互作用网络中特征模式的挖掘。鉴于蛋白质相互作用网络与实际网络之间的差异,针对蛋白质相互作用网络中近似二分模式的挖掘问题,...  (本文共63页) 本文目录 | 阅读全文>>

《中国生物化学与分子生物学报》2017年08期
中国生物化学与分子生物学报

蛋白质相互作用数据库

国家重点基础研究发展计划(“973”计划,No.2014CBA02001);国家自然科学基金(No.31571270)和北京市青年拔尖团队项目(No.201500021223TD04)资助蛋白质是构成生物体的重要生物大分子,调节和控制几乎所有的生命基础活动和高级生物学行为。从小分子的转运、代谢和信号转导,到单个细胞的增殖、分裂、分化和凋亡,几乎都离不开蛋白质及它们之间的相互作用(protein-protein interaction)。蛋白质表达量、翻译后修饰、亚细胞定位和蛋白质相互作用的变化,决定了从组织的形成、分化、器官的发育和衰老,到生物个体的发育特征、疾病和死亡。因此,蛋白质研究的一个主要方向是蛋白质相互作用组学(interactomics)。蛋白质相互作用组(interactome)研究不仅为“小科学”(small science)研究提供了重要的功能机制“线索”,而且是系统生物学研究的重要“基石”。内源的蛋白质异常(...  (本文共8页) 阅读全文>>