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人类为何如此与众不同

人类基因组密码破译后,迎接我们的是一个又一个意想不到的结果。海胆、老鼠、狗等很多外形看上去风马牛不相及的物种的基因组序列与我们的基因组序列却显示出了相当高的相似程度。如果说基因是决定遗传性状的关键因素,那么为什么我们的表象却那么千差万别? $$近期的一项研究成果回答了这个问题,5月13日发表在《美国国家科学院院刊》上的一篇文章指出,果蝇与人类的不同之处不仅在于它们基因组中基因的差别,还在于其蛋白质相互作用数量的差别,发表该文章的研究小组还发明出一种新的方法可以估算出生物体内蛋白相互作用的数量。 $$研究成果表明,虽然拥有2.4万个基因的人类基因组在基因数量上与拥有1.4万个基因的果蝇基因组相差不大,但人类的蛋白相互作用数量却是果蝇蛋白相互作用数量的10倍之多,是单细胞酵母蛋白相互作用数量的20倍。 $$蛋白质间的相互作用存在于人体所有的生理学系统中,...  (本文共1页) 阅读全文>>

权威出处: 科技日报2008-06-02
《中国生物化学与分子生物学报》2017年08期
中国生物化学与分子生物学报

蛋白质相互作用数据库

国家重点基础研究发展计划(“973”计划,No.2014CBA02001);国家自然科学基金(No.31571270)和北京市青年拔尖团队项目(No.201500021223TD04)资助蛋白质是构成生物体的重要生物大分子,调节和控制几乎所有的生命基础活动和高级生物学行为。从小分子的转运、代谢和信号转导,到单个细胞的增殖、分裂、分化和凋亡,几乎都离不开蛋白质及它们之间的相互作用(protein-protein interaction)。蛋白质表达量、翻译后修饰、亚细胞定位和蛋白质相互作用的变化,决定了从组织的形成、分化、器官的发育和衰老,到生物个体的发育特征、疾病和死亡。因此,蛋白质研究的一个主要方向是蛋白质相互作用组学(interactomics)。蛋白质相互作用组(interactome)研究不仅为“小科学”(small science)研究提供了重要的功能机制“线索”,而且是系统生物学研究的重要“基石”。内源的蛋白质异常(...  (本文共8页) 阅读全文>>

《文理导航(中旬)》2018年01期
文理导航(中旬)

蛋白质相互作用的研究方法及进展分析

蛋白质具有控制调节细胞生命活动的能力,人体内有一部分蛋白质是以单体形式存在的,但是绝大多数蛋白质是能够通过配体或以复合体的身份参与调节细胞活动的。因此,我们要想更好了解细胞知识,就必须要在现有科研能力的基础上,对蛋白质相互作用进行研究。一、当前比较常见的蛋白质相互作用的研究方法(一)GST融合蛋白采取GST融合蛋白的方式对蛋白质进行检测,查阅最新的有关蛋白质的鉴定文献资料,准确评定其存在的功能与特性。在此基础上,确定部分具备相互功能的蛋白质的所处位置。一般情况下,此种检测方法获取的结果是可信的。需要注意的是,此种研究方法还可以用于检测定量的蛋白质。(二)免疫共沉淀通常情况下,若是细胞出现分裂,且是在不稳定环境下,那么细胞内原有的蛋白质将被保存下来,这一说法已经被相关专家证实。采用此种检测方法,能够准确判定外界多变环境下相关蛋白质相互作用问题。要想发挥出此种研究方式的作用,需要做足准备工作,必须要保证在清洗环节复合体不会遭到破坏。...  (本文共2页) 阅读全文>>

《中南民族大学学报(自然科学版)》2017年03期
中南民族大学学报(自然科学版)

基于多特征融合预测蛋白质相互作用界面

区分蛋白质晶体中的生物学相互作用界面(Biological interfaces)和无生物学意义的晶体学界面(Crystal interfaces),是结构生物信息学中的一个重要研究方向.现有计算方法预测蛋白质相互作用界面的特征主要分成两大类:第一类是以界面面积、疏水性和温度因子等几何特性和氨基酸理化特性为代表的传统特征[1];第二类则是以EPPIC方法为代表的进化特征[2].为获得良好的分类效果,目前的主要策略是将上述特征进行联合.然而,这类融合方法也存在弊端,如现阶段分类效果最好的Luo方法[3],该方法具有较高的特征维度(46维),且进化信息计算复杂,不利于快速构建本地分类模型.因此,本文期望采用较为简便的方式计算进化特征,融合传统特征并使用特征选择技术,构建一个低维高效的蛋白质互作界面分类模型.1材料和方法1.1数据集,蛋白质界面残基、表面残基的定义在构建和测试模型过程中使用了三个数据集,Duarte数据集[2]作为主数...  (本文共4页) 阅读全文>>

《中国中医药信息杂志》2016年02期
中国中医药信息杂志

基于蛋白质相互作用网络分析右归丸治疗肾阳虚证的疗效机制

肾阳虚证临床主要表现为腰膝酸软、畏寒肢冷、夜尿频多等,治法以温补肾阳为主,临床以右归丸为代表方剂。右归丸出自明代《景岳全书》,由熟地黄、炮附片、肉桂、山药、山萸肉、菟丝子、鹿角胶、枸杞子、当归、杜仲组成,主要功效为温补肾阳、填精益髓,主治肾阳虚证。我们前期采用核素标记相对和绝对定量(i TRAQ)技术,对经右归丸治疗的4例肾阳虚证患者批差异表达而是以蛋白虚证疗效的的结果。因蛋白质进行杂性有全面网络建模方相互作用关机制。1资料与方1.1数据来数据来组学技术检验中8个通数据分析。1.2差异表分别计均值,采用认为该蛋白1.3蛋白质采用S差异蛋白质编号P20851 ComP00734 ProB4DN75 CarP01024 ComP02760 alphQ04756 HepE7EQB2 Lac者治疗前后的达蛋白[1]。蛋白质之间的相的发挥也是蛋因此,必须在整行研究,才能面和深入的认方法,对前期关系角度探索方法来源来源于前期实检测得到的蛋通...  (本文共4页) 阅读全文>>

《生物物理学报》2015年02期
生物物理学报

基于蛋白质相互作用“热点”区域的小分子药物设计研究进展

引言蛋白质是生命活动的执行者,通过与糖类、蛋白质、核酸等生物活性成分形成蛋白质复合物来参与细胞的生理过程和信号转导,而这种蛋白质复合物通常由蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)所控制[1]。随着分子生物学和蛋白质组学的不断发展,机体内诸多关于PPIs的网络逐渐清晰,并发现其与疾病有着密切的关系[2],可被用来预测疾病的发生机制[3]。由于PPIs发生的空间较大且平滑,而有的PPIs并未直接参与疾病的发生过程,因此,基于PPIs的药物开发极具挑战性。然而,随着PPIs“热点”(hotspot)区域被发现,以PPIs为靶点的小分子药物开发逐渐成为疾病治疗的热点问题[4]。因此,了解PPIs的“热点”区域及其与小分子药物之间的相互作用,有助于从分子水平上认识小分子药物预防和治疗与PPIs相关疾病的作用规律和机理,为新药的开发提供基础理论知识。蛋白质-蛋白质相互作用的“热点”区域P...  (本文共15页) 阅读全文>>