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我科学家绘出大熊猫“晶晶”基因组精细图

本报深圳12月14日电 (记者刘传书)今天,《Nature》(自然)杂志刊登了我国科学家最新研究成果《大熊  (本文共1页) 阅读全文>>

权威出处: 科技日报2009-12-15
《生物学通报》1992年01期
生物学通报

人类和某些动植物的基因组大小

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浙江大学
浙江大学

亚洲甘蓝型油菜基因组及其系谱的遗传传递分析

甘蓝型油菜(Brassica napus,AACC,2n=38)为世界范围内广泛种植的重要油料作物之一。对于油菜的群体演化、主要遗传群体,特别是亚洲油菜和欧洲油菜之间的基因组差别以及历史上大规模遗传渗入带来的影响等事件,研究有待深入。本研究以亚洲甘蓝型油菜及一个典型品种(宁油7号)系谱作为模型,利用多种测序技术进行全基因组水平的从头(de novo)组装和比较,揭示了亚洲油菜独特的基因组遗传印迹以及本地驯化育种过程中,由于近期发生的种间或者种内杂交渗入事件而引起的遗传负载变化。本研究为理解多倍体作物的快速演化提供了新的视角。主要内容及结论如下:(1)亚洲甘蓝型油菜基因组从头组装及其亚欧油菜基因组比较通过高通量测序技术,对亚洲经典双高油菜品种“宁油7号”进行了全基因组测序和从头组装。经拼接获得宁油7号993Mb的基因组拼接序列,其中89.8%(892Mb)的拼接序列可以组装到染色体上。基因组共注释获得104179个蛋白质编码基因。...  (本文共121页) 本文目录 | 阅读全文>>

南京师范大学
南京师范大学

江豚种群基因组学及鲸类骨骼微结构适应机制研究

鲸类作为物种演化历史上一类非常重要的次生性水生哺乳动物,成功的适应了水生环境并且快速的辐射进入到全球的各个水域。为了适应水生生境,鲸类外部形态和生理、生态产生了一系列的适应性改变。其中骨骼内部形态发生了巨大的改变,从典型的陆生形式转变为半水生的骨硬化形式,再到完全水生的骨质疏松骨骼形式。然而,这一适应性改变的分子机制尚不清楚。江豚为小型齿鲸,隶属于海豚科,江豚属。江豚分布于亚洲的印度洋和太平洋海域,以及一些大江河流中,在中国黄海、南海和长江水域广泛分布。目前对于江豚内部的分类有两种方式:第一种是将其分为三个亚种:南海亚种(N.phocaenoidesphocaenoides)、黄海亚种(N.phocaenoides sunmeri)以及长江亚种(N.phocaenoides asiaeorientalis);第二种是首先将其分为印度洋宽脊江豚(Neophocaena phocaenoides)和窄脊江豚(Neophocaena ...  (本文共133页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国农业大学
中国农业大学

玉米Mo17基因组组装及与其它玉米基因组的比较

玉米是全世界三大最重要的粮食作物(水稻、玉米、小麦)之一,也是总产量最高的粮食作物,同时还是重要的动物饲料、工业原料来源。玉米是植物遗传学研究领域的模式生物,其复杂的基因组结构及丰富的遗传信息为比较基因组学、功能基因组学、数量遗传学等重要学科与研究方向提供了很好的材料。玉米杂种优势现象非常明显,不同自交系之间存在着丰富的形态学和遗传学多样性,研究这种多样性产生的原因和机制,能够为解析杂种优势机理提供思路,并为玉米基因组基因克隆、遗传育种改良等提供重要帮助。本研究通过对玉米自交系MO17基因组进行深度测序并组装,并与B73和PH207基因组进行全基因组水平的比较,以期揭示自交系之间的遗传差异与杂种优势之间的联系。主要结果如下:1.综合使用PacBio SMRT测序技术、Bionano光学图谱技术及Illumina测序技术对Mo17自交系基因组进行组装。最终组装的Mo17基因组大小为2.18 Gb,其中contigsN50长度为1....  (本文共90页) 本文目录 | 阅读全文>>

武汉大学
武汉大学

长雄蕊野生稻基因组组装以及进化比较基因组学分析

水稻作为世界上超过一半人口的主粮,随着人口的持续增加,水稻的连续增产为保证粮食供给提供重要的支撑作用。预计到2050年,世界粮食产量比现在需要增加一倍,而野生稻具有的遗传多样性将为栽培稻提供重要的资源库,达到产量提升,稳产的目的。本研究通过组装的高质量长雄蕊野生稻基因组与两个已有的栽培种基因组比较分析,探索野生种水稻与栽培稻经历分化过程后的不同基因结构的变异规律。初步揭示了长雄蕊野生稻基因组与两个栽培稻种序列相比具有高度序列共线性,基因数目也相近,但在基因家族与转座子以及以及非编码RNA等有较大差异;同时全基因组的PAV说明高度近缘种在长时间的分化过程中积累的突变以及重组导致的片段丢失现象频繁,导致基因周边的区域突变频率高,可能在基因转录过程中起调控作用。长雄蕊野生稻作为非洲大陆的野生种,其与另外两个本独非洲水稻种的分化与起源关系很少有研究报道,基于地理分布抽样的群体重测序数据,探索了非洲三个水稻种的群体遗传分化与结构分析,阐述...  (本文共98页) 本文目录 | 阅读全文>>