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黑猩猩为何不及人聪明?

人类的近亲黑猩猩为什么不及人聪明?中、日、德、韩等国科学家联手探索3年,通过研究“黑猩猩22号染色体测序和比  (本文共1页) 阅读全文>>

西北农林科技大学
西北农林科技大学

刺槐根瘤菌种群遗传分析和比较基因组学研究

刺槐是一种近代跨洲迁移的豆科植物。刺槐迁移促进了其共生根瘤菌群之间的基因流动,然而宿主迁移对全球范围内刺槐根瘤菌的遗传结构的影响尚未明确。本研究以北美洲、欧洲和亚洲的刺槐根瘤菌为试验材料,分别利用种群遗传学和比较基因组学方法对刺槐根瘤菌共生基因的起源与进化进行了研究。主要研究结果如下:1.持家基因atpD和gln2的遗传多样性较为丰富,而rpoA的遗传多样性最低;共生基因nifH的遗传多样性最大,nodA的遗传多样性最小;共生基因的核苷酸多态性要比持家基因低至少一个数量级。6个持家基因和5个共生基因无基因重组。共生基因和持家基因都经历了强烈的纯化选择作用。2.286株中慢生根瘤菌可分为3个主要分支(Clade I、Clade II、Clade III)和1个混合分支,每个Clade至少包括17种单倍型,呈现一个星状结构的进化网络。没有任何一个单倍型同时存在于中国、德国和美国的种群中,美国种群具有较高的单倍型多样性,德国种群的共生...  (本文共127页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国农业科学院
中国农业科学院

小麦族A、S、D二倍体种全长cDNA文库构建及序列初步分析

普通小麦(T.aestivum)为异源六倍体(AABBDD),基因组庞大(1.6×10~(10)bp),重复序列多(约90%),发掘、克隆小麦新基因意义巨大。全长cDNA文库中绝大多数克隆不仅包含完整的阅读框架,还拥有5′和3′端的非编码区,是进行功能基因组学研究的一条有效途径。在引进、消化吸收的基础上,我们对Cap-trapper法做了一些具体的改进,形成了一套简单易行的技术体系,建立了我们自己的全长cDNA文库构建技术平台。利用改进的Cap-trapper法,分别构建了乌拉尔图小麦(T.urartu)A基因组,拟斯卑尔脱(Ae.speltoides ssp speltoide)S基因组和粗山羊草(Ae.squarrosa ssp strangulata)D基因组的全长cDNA文库,库容量达到了10~6,重组率超过95%,文库中全长基因的比例分别为70%、89.6%和70%。基因功能注释表明,在得到的2089个基因中,有158...  (本文共130页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国科学院研究生院(海洋研究所)
中国科学院研究生院(海洋研究所)

蓝藻信号转导系统的比较基因组学分析及重要基因功能的验证

蓝藻经过漫长的进化,在地球上具有极其广范的分布,而且对环境胁迫具有极强的耐受性,这其中信号转导系统起了至关重要的作用。蓝藻信号转导系统主要包括二元信号转导系统和丝氨酸/苏氨酸激酶。蓝藻全基因组测序工作的完成为蓝藻信号转导系统的研究奠定了基础。目前国外对蓝藻信号转导系统的研究主要集中在对单个蓝藻的单个信号系统的功能研究。本论文首先采用比较基因组学的方法对蓝藻中的两大信号转导系统从分布、结构及进化等角度进行了系统的分析,进而对其中重要信号转导基因的功能进行了验证。通过比较基因组学分析发现蓝藻中的信号转导系统的分布、结构特征与物种的生理、生态特征之间关系密切;蓝藻中丝氨酸/苏氨酸激酶具有与真核型激酶类似的催化方式;在信号转导系统的进化过程中存在着基因复制、缺失、附属功能域的获得及随机重排等复杂的进化现象;且二元信号转导系统中相互作用的组氨酸激酶与反应调控蛋白之间并不是完全同步的进化关系,可能有着不同的进化历程。该研究建立了蓝藻信号转导...  (本文共159页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

苏云金芽孢杆菌YBT-1520全基因组测序和比较基因组学研究

本论文详细报道了对鳞翅目害虫有高毒力的苏云金芽孢杆菌(Bacillusthuringiensis)菌株YBT-1520的全基因组测序以及与炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracisAmes)、腊状芽孢杆菌(Bacillus cereus ATCC 14579)和苏云金芽孢杆菌(Bacillusthuringiensis 97-27)的比较基因组学分析。介绍了它们在染色体和质粒的保守性、致病因子、可移动因子、代谢和调控以及进化方面的异同点。YBT-1520基因组由1条染色体和9个质粒组成,其中染色体的长度为5,547,282bp,编码5440个ORF;9个质粒中,最大的为293,574 bp,编码298个ORF,最小的2062 bp,编码3个ORF,9个质粒的总长度为477,287bp,共编码523个ORF。直系同源簇比较表明YBT-1520与炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis Ames)、腊状芽孢杆菌(B...  (本文共109页) 本文目录 | 阅读全文>>

江西师范大学
江西师范大学

植物腐生、病原及内生真菌中CAZymes的比较基因组学分析

作为真核生物中的一个庞大类群,真菌在自然界物质循环中扮演着不可或缺的地位。不同类型真菌在物质循环中发挥不同的作用,例如某些蕈类真菌可供人类食用,但一些真菌却对农作物具有侵染、破坏作用,如植物病原真菌。因此,如何更好地利用真菌成为了近年来真菌学的研究方向。真菌可以产生大量的碳水化合物活性酶(carbohydrate active enzymes,CAZymes),该类物质是真菌生长发育过程中极为突出的蛋白家族,与真菌的生活方式可能紧密相关,同时也是降解木质纤维素,解决能源危机绿色生物平台搭建的重要酶类系统。本研究通过比较基因组学分析腐生、病原及内生真菌三种不同营养生活模式的真菌中CAZymes组成及含量,从而了解编码CAZymes基因的数量及多样性与真菌营养方式的关系并揭示三种类型真菌对木质纤维素的不同降解能力,为后期找到高效降解生物质的微生物提供可行性。本文主要的研究内容和结果如下:1.首先,本研究对课题组中9株内生真菌的原始序...  (本文共74页) 本文目录 | 阅读全文>>