分享到:

我国计算生物学研究取得重要进展

本报上海讯 记者白毅报道 由上海药物所药物发现与设计中心(DDDC)蒋华良研究员领导的课题组,在蛋白质-蛋  (本文共1页) 阅读全文>>

《中国科学院院刊》2006年02期
中国科学院院刊

中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所

随着各类生物数据的加速增长,运用理论模型和数值计算研究生命科学的计算生物学和生物信息学已经成为最吸引人的...  (本文共1页) 阅读全文>>

《国外医学.药学分册》2006年03期
国外医学.药学分册

计算生物学的重要性

计算生物学治疗应用会议于2005年9月4~6日在英国Hinxton召开,会议旨在展示计算生物学的作用,即其不...  (本文共1页) 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

计算生物学中若干组合优化问题的研究

本文主要研究了计算分子生物学中的若干组合优化问题。全文共分为六章。在论文的第一章里,首先简要介绍了组合优化,计算生物学问题,算法和时间复杂性等基本概念。第二章主要研究了单个基因组序列的重排列问题。我们提出一种更具有一般性意义的新移位操作,并且设计出利用逆序和这种新移位操作对单染色体基因组重排列的近似算法。第三章主要研究多染色体中基因组重定位问题。针对多染色体基因组重定位的一类松弛问题,称作Syntenic距离问题,我们提出一个新的特殊可解情形,称为无覆盖特殊类,并且设计出了相应的多项式时间最优算法。第四章研究了染色体DNA序列重组合问题。我们研究这类问题的多项式时间特殊可解结构。我们针对一类“树型”结构,指出解这类特殊结构的已有算法的不完备性,并且对重组“树型”结构进行了更加全面的考虑,设计出新的算法,并严格证明了新算法的最优性。在这一章中,我们还将新提出一类DNA序列的特殊可解结构——“链型”结构,设计出了最优算法,实现了向“...  (本文共96页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国人民解放军军事医学科学院
中国人民解放军军事医学科学院

细胞信号通路中酪氨酸磷酸化修饰和SHC1、SHC3与相关信号蛋白分子作用差异的计算生物学研究

研究成熟神经元脱离细胞周期的分子机理对认识中枢神经退行性病变机理至关重要。SHC1、SHC3是细胞内起始信号分子,在结构上具有很高的同源性,都包含PTB-CH1-SH2结构域,然而在中枢神经系统中,SHC1仅表达于神经干细胞,而SHC3则仅在成熟神经元中表达,两者在细胞分布上的差异为探讨神经元脱离细胞的机理提供了良好契机:通过比较SHC1和SHC3在细胞信号通路中的作用差异,探讨神经元脱离细胞周期的机理。由于有众多上下游分子可能与SHC分子相互作用,在没有相互作用分子明确线索情况下,非常不利于直接展开实验研究,为此,我们采取先用计算结构生物学模拟得到明确线索,再有针对性地进行实验验证的策略进行研究。首先,需要建立强大的计算生物学模拟计算平台。我们以星盈超级刀片计算机为硬件,采用AMBER、CHARMM和VMD等著名软件,成功构建了一个可高效并行运转的计算生物学模拟计算平台。在此平台上,确定了磷酸化氨基酸的最适力场参数(AMBER...  (本文共181页) 本文目录 | 阅读全文>>

《情报探索》2018年02期
情报探索

基于共类分析法的计算生物学学科交叉模式演变研究

[目的/意义]为科技人员把握计算生物学的学科发展方向,制定科学的学科发展政策提供有益参考。[方法/过程]基于共类分析法,借助学科之间的内部引文流,从知...  (本文共9页) 阅读全文>>