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PCAs给我们带来了什么?

$F编者按$E$T当研究蛋白质-蛋白质相互作用的策略已经成为定义基因功能研究.生化系统与药靶标分子作用系统重要组成部分的时候,蛋白质片断互补试验(PCA)就成为了重要的选择,这是一种可以发现蛋白质相互作用表态表现的方法,而且,PCA在生物网络有机分子作用的传感器领域以及模型系统研究领域的应用,对于药物研发过程无疑有着重要的推动作用。近日,加拿大蒙特利尔大学生物化学教授Stcnhen Michnick博士等人在英国《自然综述药物发现》上发表文章,对PCA的研究进行了全面深入的论述本期特选编部分内容,以飨读者。$E$$PCAs靶向治疗潜力可挖$$对于研究抗体或其他的蛋白质靶向治疗,PCAs具有可深入挖掘的潜力。$$PCA技术的首次应用,是蛋白质一蛋白质相互作用界面的设计,例如修改亮氨酸-拉链转录因子。这些研究的成功提示,PCAs可用于检测特异性作用于靶标的蛋白质筛选库或者干扰靶标相互作用的小分子。例如,根据大肠杆菌的DHFR存活化验...  (本文共4页) 阅读全文>>

《长春大学学报》2007年04期
长春大学学报

蛋白质相互作用的研究方法及进展

蛋白质控制和调节细胞中诸多的生命活动,尽管有一些蛋白质主要以单体的形式发挥作用,但有很大一部分蛋白质,却是通过与别的配体结合或作为一个大的生物复合体中的一部分来参与细胞中的生命活动[1]。因此,了解细胞的功能必须从在孤立情况下和在与别的蛋白质分子相互作用的情况下两个层次上来认识蛋白质的功能。1已经用于鉴定和表征蛋白质间相互作用的一些标准技术1.1用GST融合蛋白研究蛋白质相互作用以GST融合蛋白为探针来鉴定蛋白质,能用新蛋白大规模筛选文库以鉴定新的相互作用,以及确定某些相互作用的蛋白质上的特定区域,虽然这种方法产生的结果是定性的,但是,GST融合蛋白可用于高度定量及复杂的分析中。1.2通过免疫共沉淀鉴定相互作用蛋白质当细胞在非变性条件下裂解时,完整细胞内许多蛋白质之间的结合保持下来,这一事实可用于检测和确定生理条件下相关的蛋白质之间的相互作用。利用该方法检测蛋白质之间的相互作用要求在一系列的清洗过程中保持复合体不变,因而该方法可...  (本文共4页) 阅读全文>>

《湖北医药学院学报》2014年02期
湖北医药学院学报

双分子荧光互补在蛋白质相互作用中的应用

生物体是一个复杂的有机体,是物质运动的高级形式,这种运动方式是通过蛋白质来实现的。人体的生长、发育、运动、遗传、繁殖等一切生命活动都离不开蛋白质。生命活动中各项功能和行为并不是由单一的蛋白质来完成的,蛋白质间的相互作用以及功能、构象变化参与和影响着生命的全过程,因此深入理解蛋白质相互作用,研究出蛋白质相互作用网络是揭示生命活动奥秘的前提。基于生物化学、微生物学、分子生物学、生物物理学和生物信息学的知识和技术,已经建立了多种研究蛋白质相互作用的方法。目前常用的研究蛋白质相互作用的方法有:GST沉降实验(GST-pull down)、串联亲和纯化、免疫共沉淀、酵母双杂交、化学交联、荧光能量共振转移和双分子荧光互补实验等。本文综述了双分子荧光互补技术(bimolecular fluorescence complementa-tion,BiFC)的起源、原理、发展以及在研究蛋白质相互作用中的应用。1双分子荧光互补的起源绿色荧光蛋白(gr...  (本文共3页) 阅读全文>>

《生命科学》2007年05期
生命科学

蛋白质-蛋白质相互作用及其抑制剂研究进展

当今是科学和技术快速发展的时期。基因组学、蛋白质组学、生物信息学、生物测定技术以及计算机辅助药物设计的发展和交叉极大地推动了制药行业的发展,制药公司投入研发的费用在近30多年内以平均每年8%的速率增长[1],但每年通过美国食品药品监督管理局(FoodandDrugAdmini-stration,FDA)批准的新分子实体(newmoleculeentities,NMEs)的数目却呈现下降的趋势(图1)。这主要是因为人们一直局限于研究靶向酶和小分子受体的抑制剂或激动剂,而没有开拓新类型的靶标。蛋白质是生物体内最重要的组成成分之一,参与几乎所有的生命过程和细胞活动。它在体内主要通过与自身或其他蛋白质以及核酸形成复合体来发挥生物学功能,基因调节、免疫应答、信号转导、细胞组装等等都离不开蛋白质-蛋白质的相互作用[2]。蛋白质-蛋白质的相互作用也因此受到越来越多的关注,成为一类很有潜力的新靶标,靶向蛋白质-蛋白质相互作用抑制剂的研究也成了热...  (本文共6页) 阅读全文>>

《赣南师范学院学报》2002年03期
赣南师范学院学报

药物与蛋白质相互作用的研究新进展

1 概述药物与人类生活有着密切的联系 ,药物的吸收分布、代谢及排泄等体内过程 ,直接影响到药物在其作用部位的浓度和有效浓度的持续时间 ,从而决定着药物的作用———药理作用和毒性作用的发生发展和消除 .药物主要通过干扰病原体的代谢而抑制其生长繁殖 ,以达到治疗的目的 ,例如 :青霉素抑制细菌细胞壁的合成 ,氯霉素抑制细菌核蛋白体的合成 ,氯喹与疟原虫的核蛋白结合 (主要是与脱氧核糖核酸 ,即DNA相结合 )抑制DNA的复制 ,使核酸合成减少 ,从而影响其生长繁殖 .药物自给药部位进入血液 ,随血液的循环再分布全身各组织器官中 ,有的药物以其原形发生作用 ,有的药物构型发生了变化 ,药物活化后再发生作用 ,药物及其代谢产物可以通过不同的途径排泄于体外 .联系药物吸收 ,分布和排泄的枢纽是血液 .药物 (不论是口服给药或注射给药 )进入血液后 ,必然或多或少与血浆蛋白 (主要是白蛋白结合 )结合型药的失去活性 ,也不被代谢和消除 ,结...  (本文共5页) 阅读全文>>

《生物物理学报》2015年02期
生物物理学报

基于蛋白质相互作用“热点”区域的小分子药物设计研究进展

引言蛋白质是生命活动的执行者,通过与糖类、蛋白质、核酸等生物活性成分形成蛋白质复合物来参与细胞的生理过程和信号转导,而这种蛋白质复合物通常由蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)所控制[1]。随着分子生物学和蛋白质组学的不断发展,机体内诸多关于PPIs的网络逐渐清晰,并发现其与疾病有着密切的关系[2],可被用来预测疾病的发生机制[3]。由于PPIs发生的空间较大且平滑,而有的PPIs并未直接参与疾病的发生过程,因此,基于PPIs的药物开发极具挑战性。然而,随着PPIs“热点”(hotspot)区域被发现,以PPIs为靶点的小分子药物开发逐渐成为疾病治疗的热点问题[4]。因此,了解PPIs的“热点”区域及其与小分子药物之间的相互作用,有助于从分子水平上认识小分子药物预防和治疗与PPIs相关疾病的作用规律和机理,为新药的开发提供基础理论知识。蛋白质-蛋白质相互作用的“热点”区域P...  (本文共15页) 阅读全文>>