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我国科研人员发现决定稻米食用品质的基因调控网络

本报讯 经过7年研究,中国科学院院士李家洋领导的科研团队发现了决定稻米食用和蒸煮品质的基因调控网络,并  (本文共1页) 阅读全文>>

《新疆大学学报(自然科学版)》2011年04期
新疆大学学报(自然科学版)

具有变时滞的随机基因调控网络的指数稳定性分析(英文)

考虑了具有变时滞的随机基因调控网络指数稳定性问题,采用了Lyapunov泛函的方法和Halanay-type不等式技巧...  (本文共6页) 阅读全文>>

《中国卫生统计》2003年03期
中国卫生统计

相关分析在建立基因调控网络中的应用

目的 讨论利用模糊相关系数建立基因调控网络。并从理论和实际应用的角度和其他相关系数方法进行相互比较。方法 以基因表达数据矩阵为出发点 ,用相关系数描述基因之...  (本文共3页) 阅读全文>>

华中师范大学
华中师范大学

表观遗传基因调控网络的非线性随机动力学研究

表观遗传的基因调控是指不改变DNA序列的前提下在转录和转录后水平上对基因表达的控制。在生物系统中各种基因表达产物之间互相作用,形成庞大而又极为复杂的基因调控网络。对基因调控网络尤其是核心网络模体的动力学行为和调控机制的研究已经成为当前系统生物学和生物信息学的热点。生物系统中的调控受到许多随机非线性因素的影响,如生命活动中由于参与生化反应的分子个数非常少而引起的明显涨落,细胞所处的微环境中随机扰动因素,基因调控中信号传递的时滞影响等,因此,在基因调控网络的研究中必须充分考虑非线性随机动力学因素的影响。本文基于非线性随机动力学理论以及数值模拟技术,系统研究了体细胞重编程过程中级联前馈型基因调控模型和肺癌细胞表型转变的双负反馈调控模型,取得的成果如下:(1)本文基于描述体细胞重编程过程的具有与门的级联前馈非线性动力学模型,在外源多能因子连续表达条件下,对细胞内各关键基因表达量的数值模拟结果能与体细胞重编程实验中各多能因子激活的延迟效应...  (本文共121页) 本文目录 | 阅读全文>>

南京大学
南京大学

基因调控网络中基序的动力学和功能研究

细胞是高度复杂的系统,由各种各样的分子构成。这些分子表现出极其复杂多样的相互作用。从系统生物学的角度看,这样一个系统可以由生化网络来描述,即相互作用的细胞分子可以视为相互连接的网络组分。研究生化网络的行为可以帮助我们在系统层面上理解细胞活动。网络基序是网络中重复出现的调控模式,它们被认为是组成网络的基石和功能单元。对基序的研究是理解整个细胞网络的基础。动力学研究可以揭示这些生物网络基序的行为和功能,解释它们所掌控的细胞活动的背后机制。尽管近年来网络基序动力学的研究已有相当的数量,但随着涉及的生物现象越来越多样,亟待解决的问题依旧很多。在这篇论文中,我重点关注耦合反馈环基序中最常见的两类动力学行为—多稳态和振荡。多稳态是细胞命运抉择中的核心主题,常被用来解释细胞分化的机制。一般定性地认为,多稳态需要耦合反馈环,且至少具有一个正反馈环。然而,耦合反馈环产生多稳态的定量条件和本质机制仍不清楚。在第一个工作中,我们构建了一个包含两个转录...  (本文共115页) 本文目录 | 阅读全文>>

上海大学
上海大学

具有转录和翻译时滞的基因调控网络的振荡动力学研究

基因调控网络中的振荡动力学行为代表了生物学中普遍存在的一种机制,发生在许多生物事件中,控制着细胞生理的各个方面,从信号传递、运动和发育到生长、分裂和死亡。然而,长期以来,这种重要的周期性行为在细胞中的产生机制以及在机体生理功能中发挥的作用都是亟待回答的重要科学问题。大量的实验和理论证据表明,基因表达是一个缓慢的过程,不可避免地涉及转录、剪接和加工以及蛋白质合成等所造成的时间延迟。特别地,这些延迟会引起mRNA和蛋白的振荡表达,对基因调控网络的动力学具有重要的影响,因而也会对细胞的生物功能产生影响。如何确定基因表达过程中的时间延迟及其在基因调控网络中的作用机制,以及如何更好地对它们进行调控等问题自然而然也成为了众多分子生物学家、系统生物学家和计算生物学家的研究热点。本论文从非线性动力学的角度出发,研究了几类典型的具有转录和翻译时滞的基因调控网络的振荡动力学及相关问题,主要工作概括如下:一.具有转录和翻译时滞的p38蛋白活性的振荡动...  (本文共123页) 本文目录 | 阅读全文>>