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虎(Panthera tigris)微卫星位点多态性及其在圈养种群管理中的应用

本文应用基于荧光标记的全自动DNA序列分析技术和微卫星多态性分析技术,从30个家猫(Felis Catus)微卫星位点中筛选了15个多态性良好、扩增结果稳定可靠的位点用于分析虎的3个亚种,即东北虎(Panthera tigris altaica)、孟加拉虎(P.t.tigris)和华南虎(P.t.amoyensis)的圈养种群的遗传多样性水平。这15位点包括Fca043、Fca074、Fca077、Fca066、Fca090、Foa107、Fca304、F53、F141、F42、Fca391、Fca453、F146、Fca441、Fca41,其中Fca043、Fca074、Fca077、Fca304、Fca453、Fca441、F42等7个位点通过测序分析获得了重复单位的碱基组成和重复次数。对36只虎15个位点的分析发现,这些位点有4-13个等位基因,等位基因频率和基因型频率分布不均衡,10个位点不符和H-W平衡(α=0.01)  (本文共153页) 本文目录 | 阅读全文>>

《食品科学》2013年05期
食品科学

微卫星在酿酒酵母研究中的应用

微卫星DNA由短的核心序列(一般1~6bp)串联重复构成,故也被称为简单重复序列(simple sequencerepeats,SSRs),如(CA)n、(GTG)n等,其中双核苷酸重复最为常见,其次为3个核苷酸或者4个核苷酸的重复。微卫星在真核生物基因组中广泛存在且均匀分布,在酵母中,每100kb就有1.8个微卫星位点[1-2]。自酿酒酵母全基因组序列公布以后,科学家开始构建搜索酿酒酵母微卫星序列的方法,并取得显著成果[2-5]。因微卫星在真核生物基因组中种类多、分布广,呈选择中性和共显性遗传,多态性丰富且在种内高度保守,一些学者已将微卫星位点的组合分析用于酿酒酵母分型和遗传多样性研究,但尚未达到该技术的最大分辨率[6-9]。鉴于此,Legras等[10-11]对41个微卫星位点的多态信息进行评估和筛选,得到6个稳定的高变异微卫星位点,而这6个位点丰富的多态性也在随后其他学者的研究中得到认可。近年来,随着微卫星序列搜索技术、引...  (本文共4页) 阅读全文>>

《黑龙江畜牧兽医》2004年09期
黑龙江畜牧兽医

微卫星DNA标记技术在畜禽遗传多样性研究中的应用

20世纪 70年代人们已经知道 ,微卫星位点是广泛分布于真核生物基因组中的一种特殊序列 ,但直到 1982年Hamada等在研究中发现从酵母到脊椎动物中普遍存在着多拷贝的多聚(dT -dG)微卫星DNA ,Tautz和Rentz证实了这一发现。尽管从发现到现在只有二三十年的时间 ,但由于微卫星具有种类多、多态性高、进化速度快以及呈孟德尔共显性遗传等优点 ,使其迅速成为了一种应用极广的新型分子遗传标记。尤其是在畜禽亲缘关系的确定、构建基因组连锁图、遗传多样性分析、基因定位及QTL分析和辅助选择及杂种优势预测等研究领域得到极为广泛的应用。1 鉴定亲缘关系在畜禽育种过程中 ,随着对动物个体及其产品要求的提高 ,准确的系谱记录是非常必要的。微卫星DNA具有高度个体专一性和多态性。Glowatzki-Mullis等[1] 用 6个位于不同染色体上的多态微卫星位点 ,解决了用血型无法解决的 35头牛的血缘关系问题 ;张于光等[2 ] 利用 ...  (本文共2页) 阅读全文>>

《山东大学学报(理学版)》2007年01期
山东大学学报(理学版)

阿利效应及其对生物入侵和自然保护中小种群管理的启示

0前言随着人类活动强度的增加,在工业化和全球一体化的同时,生态环境也在不经意间遭到破坏,对生物的生存产生不利影响.其中生境丧失和破碎化成为全球生物多样性丧失的首要原因[1].生境破碎化之所以会导致生物灭绝,是因为生境破碎化后种群被分割成许多小种群,对小种群而言,环境随机性、边缘效应等使得局域灭绝的概率增加,同时更容易受到阿利效应(Allee效应)影响[2].生物入侵对生物多样性的危害仅次于生境丧失和破碎化[1].生物入侵机制的研究是入侵生物防治的关键.入侵生物往往从一个或几个小种群开始建群,然后入侵,因此入侵生物也容易受到阿利效应的影响.阿利效应本身可以限制物种分布区的扩大,影响生物入侵策略,而入侵生物必须能克服阿利效应的影响才能得以入侵成功.尽管阿利效应最早在1949年被提出,但直到上个世纪90年代中期,才因其在保护方面的作用而逐渐被关注[3].过去对阿利效应的研究多是针对濒危生物开展的[4~6],对生物入侵的影响只是近期才引...  (本文共7页) 阅读全文>>

《安徽农业科学》2015年31期
安徽农业科学

麋鹿常见普通病例诊断与治疗

麋鹿(Elaphurus davidianus)是世界上已经在野外灭绝,通过园囿条件下安全保存,近年来又重新在原栖息地恢复野生行为的大型哺乳动物。麋鹿原产我国,是我国特有的珍稀野生动物,由于历史的、自然的原因,19世纪末麋鹿已经在我国灭绝[1]。自1985年重建北京南海子麋鹿种群开始,在近100年后麋鹿重新回到了我国。1986年,从英国7家动物园精选了39头麋鹿,作为中国政府与国外的正式合作项目,被重新引进到江苏省大丰市(当时为县),建立了江苏大丰麋鹿国家级自然区,也是世界上第一个麋鹿自然保护区,从此开始了在麋鹿原生地引种扩群、行为再塑和野生种群恢复工作[2]。野生动物保护工作者期望麋鹿种群数量得到快速增长,逐渐恢复其野生种群,经过多年努力,在大丰自然保护区通过4次野生放养试验,目前已经形成了一个265头的野生麋鹿种群,人工圈养麋鹿数量达到2 553头,2015年大丰麋鹿种群总数量已达2 818头。在此期间,随着麋鹿种群数量的增...  (本文共3页) 阅读全文>>

四川农业大学
四川农业大学

微卫星在基因组上的分布与功能及其计算方法初步研究

微卫星(Microsatellite)是基因组上由1-6个核苷酸为单位组成的重复,又称串联重复序列(Short Tandem Repeat,STR)和简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR)。在基因组上由于微卫星具有普遍的多态性,是进行群体遗传变异分析、物种起源与进化研究、基因定型(genotyping)、指纹鉴定(fingerprinting)、法医科学(forensic science)、动植物育种等的较好的遗传标记而受到广泛关注。分析微卫星在基因组上的含量、分布及其相关信息,可提高微卫星应用的预见性。特别是目前已有更大的基因组序列数据库,这些研究将获得新的、更为准确并且具有普遍意义的结果。本研究采用Per1为编程语言结合数据库技术等方法,对29个真核生物基因组和1180个原核生物基因组的DNA序列上长度超过12的微卫星进行了大规模的计算和统计分析。主要探索了如下几个问题:微卫星在染色体上的分布、...  (本文共164页) 本文目录 | 阅读全文>>