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Mitosin与ATF4的功能性相互作用及其对细胞和病毒cAMP效应元件的调控

着丝点在有丝分裂染色体忠实地传递给子代细胞的过程中起重要作用,对于遗传物质的稳定性及生物的正常发育有重要影响。Mitosin为一分子量350kDa的着丝点蛋白,它在有丝分裂期短暂定位于着丝点动粒的外层和纺缍体极。本研究利用已经鉴定的mitosin两个动粒定位功能域ATK(mitosin氨基酸序列2094~2487+2792~2887)和TG(mitosin氨基酸序列2488~3113)作为诱饵,通过酵母双杂交系统从胎盘库中筛选出mitosin结合蛋白ATF4/CREB2 N端缺失的两个部分编码区,分别位于ATF4氨基酸序列56~351和185~351。缺失实验表明,ATF4/CREB2的bZip功能域和mitosin的中心区(mitosin氨基酸序列2792~2887位置)以及2864位置的半胱氨酸是二者相互作用所必需的。利用GST融合蛋白的体外结合实验同样证实了二者的相互作用。从而表明mitosin和ATF4的结合与mitos  (本文共80页) 本文目录 | 阅读全文>>

《计算机与应用化学》2003年Z1期
计算机与应用化学

氨基酸序列的特征描述

1引言 阐释蛋白质的序列一结构一功能之间的关系是后基因组时代的一项重要任务,蛋白质数据库规模的迅速增长和计算技术的发展为这项任务的研究提供了方便。从氨基酸序列预测蛋白质的结构类和亚细胞位置是生物信息学领域两个相关而且相似的问题,首先它们都为多类模式识别问题,各种分类算法可以有效地应用于这两个问题;其次,人们发现蛋白质的结构类和亚细胞位置都和氨基酸组成(即20种氨基酸在序列中的百分组成)有关〔‘一’〕。基于氨基酸组成的概念,距离判别法[4〕、贝叶斯判别法[5〕、人工神经网络t6一8]、支持向量机[9,’侧等分类算法都已经得到应用。 然而,在模式识别问题中,不仅分类算法影响分类器的质量,特征的选取和描述也是决定分类质量的关键因素。用20个氨基酸的百分组成近似地表示一条氨基酸序列,不可避免地失去一些重要信息。例如,一条长度为50个残基的氨基酸序列,可能存在的排列方式有2050、1.lx1065种,可能的氨基酸百分组成有e(69,50)...  (本文共5页) 阅读全文>>

《蛇志》1990年10期
蛇志

天然蛇毒蛋白C激活剂的氨基酸序列及其比较

血浆蛋白C(proteinC,PC)是人体蛋白C系统的主要成分,在人体的抗凝血机制中起重要作用。α-凝血酶是其唯一的生理激活剂,它裂解PC重链氨基端精12-异亮13肽键脱下12肽,形成具有丝氨酸水解酶活化中心的活化PC而发挥抗凝作用。近年来,在天然蛇毒中发现了多种能特异性激活PC的激活剂,部分激活剂已用于基础研究及临床诊断。除Protac外(因至今仍有争议),其它不同种属毒蛇来源的蛇毒PC激活剂均具有丝氨酸蛋白酶活性。尽管目前有关PC激活剂氨基酸序列的报道不多,但比较后发现不同蛇毒PC激活剂的氨基酸序列有高度的同源性。现就这方面的进展作一简要综述。1天然蛇毒PC激活剂等丝氨酸蛋白酶样蛇毒蛋白的分布自1986年Stocker等首次从铜头蝮(Agkistrodoncontortrixcontortrix)蛇毒中发现并分离出PC激活剂(Protac)以来,迄今已发现近20多种蛇毒中含PC活化组分,它们几乎都是蝰科蛇属,其中分布最多的系...  (本文共4页) 阅读全文>>

权威出处: 《蛇志》1990年10期
《江苏农业学报》2004年03期
江苏农业学报

鸡大肠杆菌1型菌毛蛋白氨基酸序列的变异

1型菌毛是致病性鸡大肠杆菌重要的粘附因子。鸡大肠杆菌通过1型菌毛对鸡呼吸道上皮的粘附,可获得侵袭上呼吸道,直达肺部入血的通道[1]。但1型菌毛也是一种理想的免疫原,可将1型菌毛制成菌毛亚单位疫苗,用其免疫鸡体,可使鸡体获得抗菌毛抗体,阻断鸡大肠杆菌1型菌毛对呼吸道的粘附,从而防止鸡大肠杆菌病的发生[2,3]。但由于鸡大肠杆菌1型菌毛存在抗原性差异,只有用多价1型菌毛亚单位疫苗来免疫鸡体才能获得满意的免疫保护效果,这就需要对1型菌毛进行变异类型分类。为此,我们测定了分属于20种血清型的26个鸡大肠杆菌1型菌毛蛋白结构基因的序列,用分析软件对1型菌毛蛋白氨基酸序列进行分析,并与标准1型菌毛进行比较,根据其共同点和差异性进行1型菌毛变异类型的分类,为制备多价1型菌毛疫苗提供理论依据。1 材料与方法1 1 供试菌株及分析软件26个鸡大肠杆菌菌株名称及血清型分别为QE26(O115)、GX7(O78)、HJ20(O114)、Q35(O60...  (本文共2页) 阅读全文>>

《生物化学与生物物理进展》1997年01期
生物化学与生物物理进展

用有限酶切法分析蛋白质的氨基酸序列

蛋白质的氨基酸序列分析在分子生物学的研究中有着重要的作用.当鉴定出一个(些)与某发育过程或代谢环节等相关连的蛋白质时,在不知其分子特性和生物学功能的情况下,最常用的策略是分析蛋白质的氨基酸序列.根据氨基酸序列,a可以预测蛋白质的结构特征;b通过检索数据库确定该蛋白质是否有同源性蛋白质存在,由此预测蛋白质的功能;c合成简并性的寡核苷酸探针,克隆蛋白质的编码基因.  Matsudaira[1]的方法可以测定皮摩尔(pmol)蛋白质的N端氨基酸序列.此方法的特点是易于操作,不需纯化蛋白质.蛋白质混合物经SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDSPAGE)或双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(双向电泳)分离后,电印迹至聚偏二氟乙烯(polyvinylidenedifluoride,PVDF)膜上,切下所需的蛋白质带或点,即可用序列分析仪分析氨基酸序列.  如果蛋白质N端的α氨基被化学修饰后,这个蛋白质对Edman降解不敏感.无法直接测定其N端氨基酸序列.此时...  (本文共4页) 阅读全文>>

《石河子大学学报(自然科学版)》2008年06期
石河子大学学报(自然科学版)

猪AIBP基因的克隆与组织表达谱研究

载脂蛋白是脂蛋白结构、功能和代谢的核心组分。载脂蛋白AI(Apolipoprotein AI,Apo AI)是高密度脂蛋白微粒的主要蛋白质组分,在所有研究的物种中,载脂蛋白AI约占HDL中蛋白含量的62%~65%,也少量存在于血浆极低密度脂蛋白中,对胆固醇的动态平衡起到重要的作用[1]。由于Apo AI在HDL微粒中的中心作用[2],其对动物的脂质代谢有重要的调控功能并已得到试验证明,如Apo AI水平影响鸡的脂肪沉积[3~5],Apo-AI基因的变异与鸡腹脂质量和腹脂率有显著的相关[6]。载脂蛋白A-I结合蛋白(Apolipoprotein AI Bind-ing Protein,AIBP)与Apo AI相互作用参与胆固醇转运。晶体结构显示AIBP二聚体亚基有1个Ross-mann-like折叠。蛋白质表面有1个氨基酸残基组成的二分隔腔很可能是AIBP的活性位点。AIBP通过与Apo AI结合来调节血浆高密度脂蛋白的稳定性、运...  (本文共4页) 阅读全文>>