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带科主要绦虫45W和14ku/18ku基因变异的研究

本研究论文,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR),从带绦虫六钩蚴或囊尾蚴RNA扩增45W和14ku/18ku基因,利用DNAstar软件对序列进行比较与分析,对这些基因变异规律进行了研究与分析,为带绦虫蚴病疫苗和免疫诊断制剂的研制与开发提供了重要依据,为寄生虫分子遗传与变异研究提供了模型。结果表明,共获得猪带绦虫45W转录本18个,其中A型转录本8个、相应的B型转录本3个、其它B型转录本6个,以及C型转录本1个。其中45W-4B基因与国外报道的基因在序列上差异极小,但首次发现猪带绦虫45W-4基因外显子Ⅳ中出现了单核苷酸多态性(SNP)。除4B外,其它基因外显子Ⅰ的变异只发生在第58位和70位上。核苷酸变异多为单碱基突变。对于A型转录本,241-271、364-394、448-473、602-613位为高变区,500、504、507、618、630和631位的碱基也多有变异。对于B型转录本而言,45W-4B型转录本与其它B型  (本文共111页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)
中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)

两个肿瘤相关基因的结构与功能—细胞极性蛋白hASIP的不同转录本对人肝癌细胞周期和Fas/FasL介导的细胞凋亡的调节及新基因F-lana的转化作用

本文报告了两个肿瘤相关基因——人类细胞极性蛋白基因hasip(human atypical PKC isotype specific interacting protein)和新基因F-lana的结构与功能。本文首次发现人类细胞极性蛋白基因hasip的两种不同转录本hasip-sa和hasip-sb对BEL-7404细胞周期和Fas/FasL介导的细胞凋亡中的影响不同。本文还首次报告了新基因F-lana对NIH3T3细胞的转化作用。(1)本实验室对人类细胞极性蛋白基因hasip的研究已经发现,hASIP蛋白至少有五种转录本(hasip基因的17b外显子编码hASIP蛋白的aPKC结合位点,其中包含预测的aPKC磷酸化位点),包括长的转录本——hASIP-la、hASIP-lb(含有17b外显子及17b外显子缺失的长转录本),短的转录本——hASIP-sa、hASIP-sb(含有17b外显子及17b外显子缺失的短转录本),以及hP...  (本文共79页) 本文目录 | 阅读全文>>

华中农业大学
华中农业大学

甘蓝型油菜华油杂6号及其亲本的基因差异表达研究

杂种优势利用可以提高作物产量,节约土地资源,并创造了巨大的经济和社会效益,是遗传学应用于实践最成功的范例之一。杂种优势的遗传学基础已经争论了将近一个世纪,显性假说认为,杂种优势来源于等位基因的显性效应,和非等位基因间显性效应的累积作用;超显性假说则认为,杂合等位基因的互作导致了杂种优势(Bruce,1910;Shull,1908;Jones,1917)。生物技术的发展为直接在基因组水平上研究杂种优势机理提供了基础。Stuber等认为,超显性是玉米杂种优势形成的主要原因;Xiao等(1995)认为显性作用是水稻杂种优势形成的遗传基础,Yu等(1997)和Hua等(2003)认为上位性在杂种优势形成过程中起重要作用。这些研究延续了显性假说和超显性假说的争议,没有形成杂种优势机理一致的遗传学解释。从基因组水平上看,杂种的全部基因都来自双亲,杂种中并未产生新的基因。因此杂交种所表现出的杂种优势应与基因表达水平上发生变化有关,这可能成为认...  (本文共115页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

传染性法氏囊病毒粒子感染及其A节段编码基因转化细胞的转录本初步分析

传染性法氏囊病病毒(infectious bursal disease virus,IBDV)侵染鸡法氏囊组织的B淋巴母细胞,导致严重的免疫抑制。为了探索IBDV感染及其编码基因转化对宿主细胞代谢的影响,本论文以Vero细胞为模型,利用LongSAGE技术(Long serial analysis of gene expression,LongSAGE),对IBDV感染、A节段、VP2/4/3、VP5基因转染的Vero细胞进行基因表达差异分析,从不同角度挖掘病毒感染过程中,细胞基因表达的调控网络关系,寻找病毒感染与细胞抗病毒过程中重要的基因及其相关通路。(一)传染性法氏囊病病毒A节段cDNA克隆以传染性法氏囊病病毒NB株(弱毒株)基因组dsRNA为模板,采用LA-PCR一步法扩增并克隆了IBDV基因组A节段全长cDNA。序列测定结果表明,IBDV基因组A节段全长共3,259个核苷酸,包括5’、3’-端的非编码区(NCR)和两个部...  (本文共177页) 本文目录 | 阅读全文>>

《科技展望》2015年16期
科技展望

反义转录本的研究现状及意义探讨

哺乳动物基因组包含大量的非编码RNA,这些非编码RNA通常被认为在组织中功能作用很小。最近的研究表明哺乳动物基因组大量的非编码RNA中存在着隐藏着的小群体,我们这里叫做“天然反义转录本(NAT)”[1]。天然反义转录本可以在内含子,外显子,启动子,增强子,基因间隔序列以及基因组的非翻译区中找到。它们可存在于正链或负链上,与互补链上的RNA形成正义-反义复合物,调控基因的表达,近期研究发现,反义转录本表达水平在许多疾病中处于失调控状态。目前对其与多种疾病关系的具体机制还未能完全研究清楚,也正因为如此,对反义转录本的研究也越来越受到人们的关注。1反义转录本的发现与研究现状(1)反义转录本的发现。NAT最早是在病毒中发现的。1969年,Bovre K等发现大肠杆菌λ噬菌体基因组中央b2区产生两条方向相反的m RNA,一条来源于正链,另一条在负链上,两段序列都有转录且有部分重叠。后来,在原核生物和真核生物中发现了类似的转录现象[2]。在...  (本文共1页) 阅读全文>>

华东师范大学
华东师范大学

QuaPra软件的开发及其在大鼠转录组重构中的应用

RNA测序(RNA-seq)极大地促进了对不同生物体的转录组全景图的探索。然而,由于当前的分析软件和测序技术的各种限制,转录组重建仍然具有挑战性。本论文构建了一个有效的工具QuaPra(Quadratic Programming combined with Apriori,结合Apriori算法的二次规划),用于转录组的精确组装和定量。与其他目前流行的软件相比,QuaPra的灵敏度和精密度比其他当前流行的工具至少高2.7%,并且可以检测到至少26.5%更多的低丰度(0.1~1 FPKM)的转录本。此外在真实测序数据中,QuaPra比其他同类型软件正确组装的已知转录本至少多1/4。大鼠是生物医学研究中重要的模式生物,但其尚有很多基因仍未被注释。本论文使用从SEQC项目团队生成的320个样品中11种不同器官的RNA-Seq数据,使用Stringtie和QuaPra这两个转录本拼接软件重构了大鼠转录组(Rat Transcriptom...  (本文共108页) 本文目录 | 阅读全文>>