分享到:

大熊猫保护遗传学研究

目前,大熊猫野生种群的数量约1000只左右,且仅分布于我国四川、陕西和甘肃三省之秦岭、岷山、邛崃、大相岭、小相岭和凉山等六个彼此隔离的山系。多年来,有关大熊猫的研究,主要集中在生理学、生态学、生物化学、病理学、古生物学、形态学和分类学等领域,而针对该物种野生种群遗传背景方面的研究却极为鲜见。近年来,保护遗传学基础研究与实践的结果表明,物种或亚种的起源、进化历史、种群间的基因流和种群遗传多样性等遗传背景的有关参数,是制定物种保护策略之最重要的科学依据之一。小种群必然会导致近交的出现,并造成后代多态位点的丧失和种群纯合度的上升。基于此,寻找一种能有效检测种群遗传背景相关参数的遗传标记,是查明物种遗传背景的前提,而对种群大样本数的群体检测,则是衡量其遗传背景相关参数可信度的基础。文献显示,线粒体DNA和微卫星标记,目前尚不能提供足量的遗传信息以满足于对大熊猫遗传背景的评价。因此,DNA指纹因可揭示物种基因组DNA的多态性而成为迄今开展  (本文共138页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

大熊猫Ⅱ类MHC功能基因的分离及适应性进化研究

主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)是脊椎动物所特有的多基因家族,能编码种类丰富的细胞表面糖蛋白,具有呈递抗原、启动免疫应答的功能,是动物适应性免疫系统的重要组成部分。哺乳动物Ⅱ类MHC包括DRA、DRB、DQA和DQB等多个经典基因,编码呈递细菌类外源性抗原分子;Ⅱ类MHC基因的exon2编码抗原结合部位,具有高度的多态性,与物种抵抗病原体的能力及对复杂环境的适应性直接相关。本研究以大熊猫指名亚种的“卧龙种群”、“成都种群”和秦岭亚种的“佛坪-楼观台种群”共121只个体为对象,通过对功能性Ⅱ类MHC经典座位的分离和遗传变异分析,揭示了大熊猫Ⅱ类MHC基因多样性的维持机制及其与免疫相关的适应性进化特性。主要的研究结果如下:1)首创了磁珠富集杂交cDNA分离MHC基因的方法。该方法简单、快速、高效。本文运用这一方法分离获得了7个Ⅱ类MHC基因,共10条全长cDNA。该结果...  (本文共113页) 本文目录 | 阅读全文>>

四川农业大学
四川农业大学

大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)线粒体基因组研究及圈养种群遗传多样性分析

大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)是我国特有的“活化石”物种,国家Ⅰ级保护物种,被IUCN和中国濒危动物红皮书定义为濒危级。现存野生种群仅分布于陕西秦岭南麓,四川盆地西北缘的岷山和邛崃山系,西缘的大相岭、小相岭及凉山等六个山系。如今大熊猫栖息地生境严重破碎化,限制孤岛小种群间基因交流,加速近亲繁殖和遗传漂变发生频率以致种群遗传多样性降低,并且伴随着统计学、环境、灾害和遗传等随机性的不确定性因素影响,小种群难以续存。随着全球气候变暖、森林锐减、淡水资源危机等重大环境问题的加剧,大熊猫的生存面临着严峻考验,急切需要得到有力的保护。大熊猫人工繁育是迁地保护的重要环节。然而,大熊猫圈养种群正面临着遗传多样性丧失、种源枯竭和繁殖适配率下降等风险,严重制约圈养种群的维持与发展,将使得迁地保护项目实施难度加剧。圈养种群遗传学分析依赖于现存野生种群的遗传学背景信息如遗传多样性、遗传结构、亲缘地理和保护单元定义等,是大熊猫迁地...  (本文共80页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

大熊猫卧龙圈养种群亲子鉴定及种群奠基者效应研究

大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)是我国特有的珍稀濒危动物和国家Ⅰ级重点保护的野生动物。我国从1953年开始了大熊猫的人工饲养工作,至2007年底,全世界圈养大熊猫总数为242只。为了了解圈养种群的现有遗传结构以及奠基者基因在现有圈养种群中的传递和分布情况,本文以国内最大的大熊猫圈养种群一四川卧龙中国保护大熊猫研究中心的101只个体(野外出生:22;圈养出生:79)为研究对象,采用7个微卫星位点和4个主要组织相容性复合体(MHC)座位,检测圈养种群中等位基因的多样性及分布频率,分析该种群受到奠基者效应影响的情况。主要研究结果如下:(1)采用7个微卫星DNA位点(Aime-3、Aime-5、Aime-10、Aime-11、Aime-13、Aime-14)进行群体检测所获得的相关参数如下:等位基因数量的均值为8.3(4-12),且各位点多态信息含量(PIC)的均值为0.746(0.614-0.879),表明种群具...  (本文共77页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

大熊猫基因资源库构建及粪便高质量DNA提取方法的建立

1.本文以大熊猫的成纤维细胞和肝组织细胞为材料,以pBeloBAC11为载体,构建了大熊猫基因组的细菌人工染色体DNA文库。该文库包含了93700个克隆,分别保存于977块96孔细胞培养板中。经过对100个随机抽样的克隆分析表明,插入片段的平均大小为160kb,相当于大熊猫基因组的5倍,即5个库容量。酶切10个克隆证明,经过100代繁殖后,其插入片段仍稳定不变。2.采用RNeasy Mini Kit提取大熊猫肝脏和脑组织的总RNA,经oligotex试剂盒纯化得到mRNA。利用SMART(switching mechanism at 5'end of RNA transcript)技术,构建了肝脏和脑组织的全长cDNA文库。在构建完成的文库中,肝脏文库含有约5.0×10~6个重组子,而脑组织文库含有约3.5×10~6个重组子。在2个文库中,插入的cDNA长度为400bp—4kb,重组率高达90%以上。鉴定结果表明,大熊猫肝脏和脑...  (本文共85页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

大熊猫主要组织相容性复合体Ⅱ类基因研究

大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)是我国特有的国家Ⅰ级珍稀濒危保护动物。目前仅分布于陕西、四川和甘肃三省的秦岭山脉和岷山、邛崃与凉山山脉等青藏高原东缘的边缘地区。根据国家林业局和世界野生动物基金(WWF)截至2004年、历时4年的对大熊猫及其栖息地的全面调查结果,我国现存野生大熊猫约1600只。一万多年以来,由于受晚更新世冰川末期的影响,以及人类在其漫长的历史发展岁月中对栖息地的逐步蚕食,分布于秦岭、岷山、邛崃、凉山、大相岭和小相岭等六个山系的大熊猫,已成为六个孤立的小种群,且秦岭种群已分化为大熊猫的一个亚种——秦岭亚种(Ailuropoda m.qinlingensis)。大熊猫的人工圈养繁育工程始于20世纪80年代。迄今为止,圈养于世界各地的大熊猫共有183只。其中,中国大熊猫保护中心(卧龙)及其所属的碧峰峡基地(雅安),以及成都大熊猫繁育研究基地共有大熊猫143只,是最大的三个人工圈养种群,占圈养大熊猫...  (本文共98页) 本文目录 | 阅读全文>>