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中国鹿类动物线粒体12S rRNA基因序列的比较分析及分子系统发育研究

本论文应用线粒体12S rRNA基因全序列对中国鹿类动物的系统发育进行研究。实验共计完成中国鹿类14个物种21个个体的12S rRNA基因测序,获得16个单倍型,并报送GenBank(序列号:AY184425-AY184440)。将上述序列与从GenBank检索到的獐、麂、水鹿、牛、马、羊、鼷鹿的12S rRNA基因全序列一起,通过应用分子系统学理论与模型分析序列数据,以及对12S rRNA二级结构的分析,得出了以下主要结论:(1)用最小进化方法(ME)和邻接法(NJ)对12S rRNA基因的全序列构建分子系统树的拓扑结构基本相同。(2)鹿科种内距离小于1%(0.1%~0.42%);鹿属内的物种间距离小于4%(1.29%-3.44%);鹿亚科内物种间距离为4.65%-8.86%;鹿科与牛科间的距离为11.75%-14.13%。(3)分子系统学结果支持狍从美洲鹿亚科转入獐亚科,并为其中的一个独立的属(狍属)。(4)黑麝与马麝的12  (本文共98页) 本文目录 | 阅读全文>>

《菌物学报》2011年06期
菌物学报

核糖体RNA二级结构对拓扑结构准确性的影响(英文)

菌物学报 INTRODUCTION As phylogenetic markers, the ribosomal RNA (rRNA) genes have been extensively used in investigations of fungal molecular systematics. Phylogenetic analyses based on rRNA genes have renewed our understanding of relationships among fungi. However, the heterogeneous nature of rDNA evolution remains a common problem in the analyses. Hyper- variations in length, substitution rate or base composition amon...  (本文共8页) 阅读全文>>