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鸭遗传图谱的构建及重要经济性状基因座的初步定位

鸭遗传图谱的构建是重要经济性状基因座(QTL)定位及其主效基因克隆研究中不可缺少的部分,而后者又为鸭遗传改良提供理论依据。然而,至今未见关于鸭遗传图谱构建及QTL定位的研究报道。本文旨在通过构建鸭微卫星富集文库克隆大量微卫星DNA序列,利用克隆的序列设计引物,并通过PCR扩增及其扩增片段大小的分析,检测来源于两个北京鸭品系的三代群体基因型,在此基础上通过遗传连锁分析构建鸭第一张遗传图谱,并应用区间定位方法发现一些对生长、屠体及肉质性状具有显著作用的QTL。本研究应用链亲和素捕捉方法构建了富集(CA)n、(CAG)n、(GCC)n及(TTTC)n重复类型的鸭混合型微卫星富集文库,序列测定结果表明,1181个随机克隆中832个含有10bp以上核心序列,571个克隆核心序列≥15bp,富集率为73.18%,平均插入片段长度为372.87bp;完全型、不完全型、复合型及其它类型微卫星的比例分别是65.29%、13.29%、8.25%及1  (本文共114页) 本文目录 | 阅读全文>>

南京农业大学
南京农业大学

异源四倍体棉花遗传图谱的构建与分子细胞遗传学研究

利用加倍单倍体(DH)群体进行遗传图谱构建,不但有利于图谱的不断加密,便于饱和图谱构建,而且其群体繁殖简便易行,利于不同研究者间合作与交流,从而获得更精确的结果。本实验室曾利用具半配合特性的特殊材料vSg为母本,利用海岛棉Hai7124和陆地棉TM-1杂交产生F_1作父本,创建棉花的一个DH永久性作图群体,初步构建四倍体栽培棉种的分子连锁遗传图谱。但该图谱的作图群体只有58个植株,并且图谱的标记数量及覆盖度较饱和连锁图谱概念仍有一定差距。因此,本研究在原有理论和方法基础上,鉴定出新的单倍体并经加倍获得DH植株,构建了一个包含73个植株的新的DH作图群体,利用新开发出SSR引物进行图谱的构建。新图谱含有444个SSR位点,组成40个连锁群,标记位点间平均距离为7.35cM,覆盖基因组3262.9cM遗传距离。其中,29个连锁群根据单、端体定位结果分别定位到19个染色体上(1-6,9-12,14-18,20,22,23,25和26)...  (本文共157页) 本文目录 | 阅读全文>>

《微生物学通报》1989年04期
微生物学通报

巨大DNA分子的制备与操作进展

(一)绪t 当今分子生物学中有关基因组顺序组织的研究主要是通过遗传图谱和物理图谱所提供的信息。在某些较简单的物种中,遗传图的分辨率可达单个碱基对的水平,但在其它物种如大部分寄生性原生动物中,根本就未能研究其遗传图谱,因为尚无合适的研究方法。哺乳动物遗传图谱的分辨率在,cM至25cM之间(小鼠基因组为1600eM,人为3300cM)。虽然靠传统的方法可以稍稍提高分辨率,但需花极大的气力。当今的分子生物学技术仅能分析几百Kb的距离,而小鼠中Z000Kb相当于IcM,人中10。。Kb相当于IcM。因此,传统的遗传图谱的分辨率与分子生物学方法的分析范围之间有一条鸿沟。 最近几年发展起来的巨大DNA分离方法弥补了这条鸿沟。这些方法可以使得人们在50Kb一loMb的范围内观察到DNA的重排现象、绘制物理图谱等。这些方法发展迅速【,·,’o (二)Mb DNA分子的纯化与操作 众所周知,在水溶液中很难对Mb大小的DNA分子进行工作,因为这样大...  (本文共4页) 阅读全文>>

西华师范大学
西华师范大学

利用EST-SSR分子标记构建小麦遗传图谱

遗传图谱在作物的遗传改良、加快育种进程和功能基因定位与克隆的研究中起着十分重要的作用。随着现代分子生物学的不断发展,越来越多的分子标记被开发,分子标记辅助选择育种技术给育种带来了新的方法和途径。本研究以川麦42与川农16杂交后自交获得的重组自交系群体和Syn-SAU-1与三雌蕊突变体(TP)杂交后的F_2群体为材料,采用EST-SSR分子标记技术,整合前人的分子标记,构建了两张小麦的遗传图谱,具体结果如下:1.利用585对EST-SSR引物对川麦42和川农16及其杂交后的重组自交系群体进行PCR扩增,其中有555对引物有扩增产物,有效率为94.87%;其中69对引物在两个亲本中表现出多态性,多态率为11.79%。2.通过Joinmap4.0作图,获得川麦42×川农16重组自交系群体的遗传图谱,该图谱共包含14个连锁群,由168个标记组成,包括73个FSRAP标记,75个SSR标记,20个EST-SSR标记,覆盖基因组长度1680...  (本文共51页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国农业科学院
中国农业科学院

D基因组二倍体棉种D_(3-d)和D_(3-k)种间杂交种的SSR连锁图谱

四倍体棉品面临的问题为遗传基础狭窄,关键在于如何获得种间杂种并将种质资源由野生棉直接引入到优良品种中。遗传图谱的构建为理解基因组结构,进化过程中生物体间的相互关系以及发现植物重要农艺性状的基因提供了深入的见解。在这项研究中,我们建立了两个二倍体野生棉戴维逊氏棉和克劳茨基棉间的种间杂种和188个F_2群体,用于开发遗传图谱。我们筛选了12560对SWU简单序列重复序列(SSR)引物,获得1000个多态性标记,仅占8%。共成功获得928对多态性引物,只有728对在13条染色体上有效连锁,但分布不对称。图谱长度为1480.23 cM,相邻标记间平均长度2.182 cM。在2号、5号、7号和8号染色体中观察到高分离畸变,大多数畸变标记偏向于克劳茨基棉。图谱上的高比例标记和雷蒙德氏棉的物理图谱显示出极显著的共线性,有两种类型的重复,分别为染色体内重复和染色体间重复。共发现94个标记是重复的,染色体间重复的标记数目最多。Dt亚基因组的遗传图...  (本文共84页) 本文目录 | 阅读全文>>

西南大学
西南大学

陆地棉×黄褐棉种间遗传图谱加密及其染色体结构分析

棉花是世界上最重要的天然纤维作物,同时也是重要的油料和粮食作物。棉花遗传图谱的构建是棉花分子育种的基础,其可以标记重要农艺性状基因,在QTL定位、图位克隆和分子标记辅助选择(marker assisted selection,MAS)等方面具有重要地位;同时构建棉花遗传图谱也是理解棉花基因组结构,解释棉花进化过程中基因形成和变异的主要方式。黄褐棉(Gossypium mustelinum L.)是一个异源四倍体野生棉种,在5个四倍体野生棉种里,其与栽培品种陆地棉亲缘关系最远,它的农艺性状除了具抗黄萎病等优点外,还具有纤维品质优良的等位基因。构建陆地棉和黄褐棉种间杂交群体,将黄褐棉野生种的优质基因导入栽培品种陆地棉,利用棉属种间高遗传多样性的特点,可丰富棉花种质资源和挖掘更多的有利等位基因,改善目前我国棉花生产面临的栽培品种单一,遗传基础狭窄的问题;同时也为黄褐棉染色体和基因组结构研究提供依据。本实验室前期将陆地棉和黄褐棉作为亲本...  (本文共85页) 本文目录 | 阅读全文>>