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全基因组扩增技术应用于法医学实践的系统研究

目的:本文拟对简并寡核苷酸引物PCR(DOP)和扩增前引物延伸(PEP)两种全基因组扩增技术在法医学实践中的应用价值进行探讨,对其应用于法医学实践的可行性进行系统评价。方法:对两种全基因组扩增(WGA)技术中可能出现STR滑脱现象的影响因素进行研究,然后在控制这些滑脱影响因素的基础上建立稳定可靠的技术方案;将该技术方案应用于法医学的单基因座扩增聚丙烯酰胺凝胶电泳银染检测系统、多色荧光标记复合扩增毛细管电泳激光自动检测系统以检验两种技术应用于法医学常用STR基因座的可靠性;将该技术应用于法医学常见微量检材单根毛发和指纹的DNA分析,对其法医学应用价值进行评估。结果:初步建立了基于DOP技术的STR滑脱机制模型,对WGA技术中可能导致STR滑脱现象的影响因素得到了解和阐述;在控制WGA技术中可能导致滑脱现象发生的影响因素的基础上,通过优化组合,建立了可靠稳定的PEP和DOP两种WGA技术方案;两种技术方案应用于法医学单基因座STR分  (本文共139页) 本文目录 | 阅读全文>>

《中国法医学杂志》2017年04期
中国法医学杂志

广东惠州客家人23个Y-STR基因座遗传多态性

1材料与方法1.1样本来源按照知情同意原则,用FTA血样采集卡采集567名无关健康男性个体的外周静脉血,所有个体均为三代以上居住在惠州地区的汉族客家人。1.2 DNA提取与基因分型应用Chelex-100法提取样本基因组DNA。按照试剂盒的操作手册,用Power Plex?Y23 System试剂盒扩增所有样本基因组DNA;扩增产物用3500XL遗传分析仪分型。1.3数据分析应用Arlequin 3.5软件分析23个基因座的等位基因频率、基因变异度(GD)、单倍型变异度(HD),比较不同群体的单倍型分布。按照文献方法计算23个Y-STR的鉴别能力(DC)[1]。2结果与讨论惠州汉族客家人群体中,DYS385a/b观察到47种单倍型,23个基因座的等位变异度值和基因频率分别见表1和表2。经群体遗传学分析,除DYS385a/b基因座外,惠州客家人群体中DYS391的基因变异度最低,DYS567的基因变异度最好。在本群体中,DYS45...  (本文共2页) 阅读全文>>

《法医学杂志》2017年04期
法医学杂志

南通汉族人群17个Y-STR基因座的遗传多态性

南通位于中国东部的江苏省境内,是长江三角洲北翼的一座地级市。由于历史等原因,南北人群的数次碰撞与融合使得南通的人群遗传结构趋于复杂[1]。本研究分析了南通汉族人群样本的17个Y-STR基因座,并将其等位基因分布频率与其他中国人群比较,以探索这些人群之间潜在的关系。1材料与方法本研究在知情同意的原则下,采集343名南通汉族男性无关个体的外周血样本,通过Chelex-100法提取基因组DNA,用Amp F詛STR YfilerTM试剂盒(美国Thermo Fisher Scientific公司)在9700型PCR仪(美国AB公司)上进行扩增,用3130xl型基因分析仪(美国Thermo Fisher Scientific公司)进行毛细管电泳,用GeneM apper誖ID v3.2软件进行基因分型。17个Y-STR基因座的分型和等位基因命名都基于国际法医遗传学学会(International Society of Forensic ...  (本文共5页) 阅读全文>>

《法医学杂志》2017年04期
法医学杂志

亲子鉴定中STR基因座可疑多步突变2例

1案例两位母亲(胡某与杨某)均因为自己女儿(刘某与李某)办理出生医学证明所需,委托我中心进行亲子关系鉴定。本中心采集四位被鉴定人指尖血备检。用Chelex-100法提取基因组DNA,分别采用AGCUEX22、AGCU 21+1试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司)对常染色体上39个STR基因座进行复合扩增,并用Power Plex誖16 HS试剂盒(美国Promega公司)对常染色体上15个STR基因座进行复合扩增,对上述检验结果进行复核验证。同时,采用AGCU X12试剂盒(无锡中德美联生物技术有限公司)对X染色体上12个STR基因座进行复合扩增。以上扩增均在9700型PCR仪(美国AB公司)上完成,扩增体系和扩增条件均依照试剂盒使用说明书,PCR产物在3130xl基因分析仪(美国Thermo Fisher Scientific公司)上进行毛细管电泳,用Gene Mapper誖ID v3.2软件进行STR分型。先用AGCU E...  (本文共2页) 阅读全文>>

《中国法医学杂志》2016年01期
中国法医学杂志

河南汉族人群27个Y-STR基因座的突变观察与分析

Y染色体为男性特有的父系遗传染色体,Y-STR单倍型分析有助于推断男性个体的区域或姓氏来源,可用于家系排查、亲缘关系鉴定、混合样本检验等方面,并已有很多实际案件的应用报告[1]。随着Y-STR数据库的建设和在群体遗传学中应用的增加,Y-STR基因座等位基因的突变问题越来越受到关注[2-5]。本文通过对河南1 000对已确定父子关系案例样本中27个常用Y-STR基因座进行检验,对等位基因突变情况进行统计分析,希望能为数据库的建立和应用提供基础数据,也可为日常检案计算结果中防止错判提供数据参考。1材料与方法1.1样本来源1 000对经常染色体STR检测已确定父子关系的血纸质样本(共2 000份),均系本实验室日常检案中积累,样本来源者均为河南汉族。1.2方法使用BSD-QP型打孔机(BSD公司,澳大利亚)打取直径1.2mm样本,采用STRtyper-27Y荧光标记复合直接扩增系统(宁波海尔施基因科技有限公)进行扩增,反应总体系为10...  (本文共5页) 阅读全文>>

《刑事技术》2004年01期
刑事技术

利用犬STR基因座检验认定犬精斑1例

1 案情简介2 0 0 3年 7月 2 3日 ,某地发生一起恶性强奸案 ,犯罪嫌疑人万某将其前女友骗至其家中 ,将该女灌醉后强奸 ,随后万某将其所饲养的雄性大丹犬的生殖器插入该女的阴道 ,并推犬的臀部 ,直至该犬射精。2 检验情况收检的检材包括受害人、犯罪嫌疑人、血痕、大丹犬的血痕 ,受害人的阴道擦拭物。阴道擦拭物酸性磷酸酶试验阳性 ,镜检可见精子。采用二步消化法提取阴道擦拭物中的精子DNA ,用chelex - 10 0树脂法提取受害人、犯罪嫌疑人及犬的血痕DNA ,分别用ProfilerPlus(ABI)、CanineI ,Version 3.0 (ABI)两个试剂盒对上述检材进行复合扩增 ,得到结果见表 1、2和图 1。表 1 ProfilerPlus扩增结果检 材D3S1 358vWAFGAAMELD8S1 1 79D2 1S1 1D1 8S51D5S81 8D1 3S31 7D7S82 0受害人 1 5/1 6 1 6...  (本文共1页) 阅读全文>>