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家畜遗传多样性及其检测方法

1家畜遗传多样性概念及其研究意义1.1家畜遗传多样性概念家畜(包括家禽)遗传多样性是生物多样性中与人类生活直接相关的一部分,是指所有的家畜及其野生近缘种的种间和种内的遗传变异的总和,其中包括了不同种家畜间的遗传变异差异,还包括了同种家畜内不同品种间和品种内共同的和特异的基因及其组合体系。家畜是生物界特殊成员,它是人类长期人工选择的产物。尽管家畜只限于为数不多的几个物种,但是由于多种利用的需要,经过了强度选择和杂交后,产生了许多前所未有的变异和特性,形成了每个种内众多的在经济性状上丰富多彩的地方品种和类型,即同一家畜种内其品种的多样性。因此物种多样性在家畜上最重要的还是指其品种和类型的多样性[1],在根本上是其群体内的遗传多样性,当然其中包括了现存家畜祖型(或称家畜野生近缘种)的遗传多样性。广义的家畜遗传多样性具体主要体现在:品种资源份数、起源系统、生态类型、生产力类型等。仅以我国为例,80年代初完成的家畜资源普查,被认可后公布的...  (本文共5页) 阅读全文>>

西北农林科技大学
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中国四个畜种(黄牛、水牛、牦牛、家驴)线粒体DNA遗传多样性研究

从我国陕西省、山西省、湖南省、内蒙古自治区及河南省采集秦川牛(QC)、西镇牛(XZ)、晋南牛(JN)、岳阳牛(YY)、蒙古牛(MO)、南阳牛(NY)、郏县牛(JX)与中国黑白花奶牛(BW)共8个品种的样品,利用PCR技术,自行设计了一对特异性引物,用于扩增中国黄牛线粒体DNA D-loop区910bp全序列。用Clustal W(1.82)软件对8个黄牛品种22个个体的D-loop区全序列进行同源序列比对与深入分析,结果表明:1.1 中国黄牛线粒体DNA D-loop核苷酸位点突变类型有五种,即转换、颠换、插入、缺失及转换与颠换共存。碱基转换以T〈=〉C形式为主,占62.96%,A〈=〉G占37.04%。本文还发现一个特殊位点,即266位点,出现碱基突变C〈=〉G〈=〉A〈=〉T,在22个黄牛个体中,碱基G出现12次,占54.55%,碱基A6次,占27.27%,碱基C3次,占13.64%,碱基T1次,占4.55%。本文把266...  (本文共130页) 本文目录 | 阅读全文>>

贵州大学
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贵州四个山羊品种mtDNA Cytb基因多态性研究

本研究对贵州山羊四个山羊品种,共计55个个体mtDNA细胞色素b基因片段进行测序分析和比较,55头贵州山羊mtDNA Cytb基因序列长均为1140bp,且以起始密码子ATG开始,中间没有插入/缺失,以终止密码子AGA结束。分析其碱基组成和序列间碱基的变异,在55个贵州山羊个体Cyt b基因序列中,总共发现11个变异位点,11个多态位点中转换61次(59次C/T转换、2次A/G转换,10次T/G颠换)。其中有59个变异为同义变异,有2个变异为非同义变异;观察到9种单倍型,各品种中单倍型多样性为0.442—0.889,核苷酸多样度为0.00145—0.0025,这表明贵州山羊的遗传多样性处于中等水平;实验所得4个贵州山羊存在两个母系起源,即支系A(Lineage A)和支系B(Lineage B)。其中支系A中存在5个单倍型GZB1、QDX2、QDX3、GZW4和GZW5占76.36%(42/55),支系B中也有5个单倍型QDX1...  (本文共42页) 本文目录 | 阅读全文>>

扬州大学
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中国牛亚科家畜六个群体遗传多样性与遗传分化及其统计方法的研究

用中心产区典型群随机抽样采集中国牛亚科家畜四个牛种(普通牛(Bos taurus)、瘤牛(Bos indicus)、牦牛(P(?)ephagus grunniens)、亚洲水牛(沼泽型,Bubalus bubalis-swamp type))六个代表群体(鲁西黄牛、渤海黑牛、闽南黄牛、青海牦牛、中国荷斯坦牛和山区水牛)共346个个体,用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和淀粉凝胶电泳(SGE)检测编码血液蛋白(酶)21个基因座和12个微卫星位点的遗传多态性,利用不同的统计方法对结果进行分析。同时基于联合国粮农组织家畜遗传多样性信息系统(FAO-DAD-IS)提供的20个主要中国黄牛品种的相关信息,结合由6个血液蛋白基因座计算所得的标准遗传距离,运用Weitzman遗传多样性分析方法对20个中国黄牛品种进行了分析,结果如下:1、利用21个血液蛋白(酶)基因座所得结果,统计群体内及群体间遗传多样性,用UPGMA和NJ法构建标准遗传距离和...  (本文共175页) 本文目录 | 阅读全文>>

贵州大学
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贵州三个地方猪种遗传多样性及亲缘关系研究

提取宗地花猪、关岭猪和江口箩卜猪线粒体总DNA,参照国外已有报道的猪种线粒体基因组D-LOOP序列设计引物,PCR扩增、胶回收纯化、克隆、测序,获得此三种猪的线粒体D-LOOP高变区580bp序列,以此进行生物信息学分析和准确的系统发育分析,基因组结构和碱基组成上相似,其序列同源性都较高。对宗地花猪的线粒体d-loop克隆测序,得出其全长1201 bp序列,发现存在个体长度异质性,初步探讨了串联重复序列的数目变异导致D-loop区长度异质性,产生这种数目变异的原因可能是不对称复制过程中的滑动错配造成的影响。利用GenBank检索得到的线粒体d-loop高变区序列,我们讨论了宗地花猪、关岭猪及江口萝卜猪和已报道过的31个猪种之间的起源进化关系,以线粒体控制区高变区构建进化树,我们分别通过两种不同的方法构建了进化树,都得到了基本一致的结论:①国内猪种和国外猪种呈现出明显的两个大类群,宗地花猪、关岭猪和江口萝卜猪毫无争议的归类于国内类...  (本文共69页) 本文目录 | 阅读全文>>

南京农业大学
南京农业大学

巴什拜羊生物学特性及其遗传多样性研究

我国是世界养羊大国,新疆是我国主要绵羊生产基地,巴什拜羊是新疆乃至国内外不可多见的地方优良品种,具有特殊生物学特征和特性。近年来,虽然对巴什拜羊进行了本品种选育为主的多方面常规育种工作,但对巴什拜羊的生物学特性和遗传多样性方面分子水平的研究很少,未见从形态特征到分子遗传标记的系统研究报告。本文采用从形态标记、细胞遗传标记、生化标记到分子遗传标记的各项研究方法,比较系统的研究了巴什拜羊的生物学特性和遗传多样性,为今后肉羊生产中常规育种与分子育种相结合的研究、传统畜牧业的提升、区域经济的发展提供一些实践和理论依据。1.巴什拜羊生物学特性研究发现(1)巴什拜羊种质特性研究显示:巴什拜羊的外形呈方圆形,躯体各部位结构匀称,肉用型明显,遗传性稳定、属于结实性体质。毛属粗毛,毛色以宗红色毛为主,有黑色和白色毛。角形以公母羊都无角为主,有两角和多角形。巴什拜断奶公、母羔羊生长指标之间没有明显差异,生长指标的差异随着年龄的增加而加大,到成年差异...  (本文共178页) 本文目录 | 阅读全文>>