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小分子药靶——RNA药靶研究进展

现代新药研究与开发离不开筛选模型 ,而筛选模型的关键是寻找、确定和制备药物筛选靶———分子药靶 .选择确定新颖的有效药靶是新药开发的首要任务 .传统的小分子药靶多是蛋白质 ,近年来的研究表明同DNA的双螺旋结构相比 ,RNA结构具有令人惊奇的复杂性和多样性 ,同蛋白质一样形成复杂的三级结构 ,RNA的三级结构作为分子相互作用的识别位点和结合位点对RNA的生物功能的实现具有重要决定作用 .RNA分子同蛋白质一样将成为新型小分子药物的作用靶点 ,为制药业提供了新的机遇 .1 RNA药靶的优越性基因组计划的顺利进行为RNA作为药靶提供了机遇[1,2 ] .基因组测序揭示了编码蛋白质的mRNA信息 ,而所有的蛋白质都是mRNA翻译获得的 ,通过干扰mRNA的翻译 ,可以更有效地抑制蛋白质发挥作用 .因此 ,结合RNA的小分子药物还可以产生结合蛋白质的小分子药物所达不到的作用 .除了抑制蛋白质的产生 ,还可以提高蛋白质的量 .因此 ,有可...  (本文共4页) 阅读全文>>

重庆大学
重庆大学

基于药靶严格确证的可药性发现和药靶预测新型算法构建

从人类基因组的破译,到基因组学、转录组学、蛋白组学等组学技术的快速发展,都为药物研发与药靶发现提供了机遇和挑战。但是,随着药物、药靶的研究的不断深入,药靶发现进程由于一些关键问题而大大延迟,比如:1)治疗药靶定义模糊,2)临床试验药物及其药靶覆盖率不足,3)耐药性突变信息不足;4)药靶基因表达谱信息和药靶组合信息不足,5)缺乏成功药靶、临床药靶和药靶组合的可药性特征,6)现有药靶预测工具预测能力较弱,等。为了解决这些问题,本研究在药靶严格确证的基础上对药靶可药性进行了系统性分析,并构建了药靶预测新型算法,具体讨论如下。第一,提出了严格的基于药、靶、病三者关联的药靶确证新策略。药靶的确证不仅需要考虑药物对药靶的活性,更要先通过活体实验(基因敲除等)验证药靶在疾病模型中的作用,再找到药物对药靶的作用会在疾病模型(细胞、体外或活体)中产生疗效的证据。第二,在药靶严格确证新策略的基础上,确证了大量批准和临床药物的药靶,并收集了多种对药靶...  (本文共146页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)
中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)

候选抗生素药靶识别系统

传统致病菌耐药性的增强和新型致病菌的出现,使得传染病越来越成为人类健康的重大威胁。人类迫切需要新型抗生素,而基因组计划则提供了一个抗生素开发的新策略。本论文利用生物信息学技术,分析了所有已测序致病菌基因组,建立了一个候选抗生素药靶识别系统。我们相继发展了四个相关生物信息学方法并最终整合进系统中。第一,建立了一个分布式BLAST系统,这是一个松耦合的异构并行系统,在任务级上实现BLAST的并行化,具有强大、经济、移植性好、伸缩性强的特点。第二,综合考虑了GC含量差异、二核苷酸丰度差异和密码子频率差异三种DNA组成分析指标,利用迭代的判别分析方法对已知的致病岛数据进行学习,得到一个线性的识别模型,用于识别致病岛及其他组成异常基因簇。第三,从文献和数据库中收集已知的致病菌毒力因子,建立了一个毒力因子数据库,用于大通量地识别细菌基因组中相关基因。第四,开发了一个文献挖掘工具MedBlast,能够搜索与给定序列相关的文献,初步测试表明其敏...  (本文共100页) 本文目录 | 阅读全文>>

《世界临床药物》2010年03期
世界临床药物

潜在药靶的发现和验证

随着人类基因组的破译、人类元基因组的启动以及后基因组时代的到来,确定所有的基因及其表达谱,了解基因所编码的蛋白质的空间结构、修饰加工,以及蛋白质间的相互作用等,已成为生命科学领域的热点。蛋白质扮演着构筑生命大厦的“砖块”角色,蕴藏着开发疾病诊断方法和新药的“钥匙”。人类基因组、蛋白质组和药物是生命科学研究中的三个重要内容。生命科学前沿技术与药物研究的交叉结合日益密切,一些新兴学科越来越多地参与到新药的研发中,特别是药物作用靶分子的发现对发展创新药物、生物诊断和生物治疗技术以及实现“从基因到药物”的药物创制战略具有十分重要的意义。由于历史、经济和科技基础等原因,与发达国家相比,我国对自主创新药物的研究投入相对较少,研发力量薄弱,难以面对国际竞争的强烈冲击。我国药政部门历年批准的上市新药中创新药物极少。如不采取有力措施改变这种状况,势必将威胁我国医药产业的生存和发展。“十一五”计划中“重大新药创制”科技重大专项以及国家科技支撑计划项...  (本文共8页) 阅读全文>>

《中国生物化学与分子生物学报》2005年01期
中国生物化学与分子生物学报

防治癫痫的新药靶BDNF受体TrkB

大多数癫痫治疗在疾病得到控制后才开始 .患者可以服用抗惊厥药物来中止发作 ,或是用外科手术切除脑的损害部分 .现在科学家用基因工程小鼠鉴定了一个脑中的新药物靶 ,它可能最早阻止癫痫 .癫痫扰乱了神经细胞之间的信号流动 ,在癫痫发作期间 ,同步的强烈、反常的电脉冲扰乱了正常的脑功能 .癫痫可能源自出生缺损、中风、头部创伤 ,但科学家尚未知晓该病的根本机制 .科学家认为 ,不管癫痫的病因有多大差异 ,总有一条普通的线索可寻究 .研究者怀疑 ,在神经细胞中 ,通常一个良性的脑蛋白及其分子停靠部位 ,即受体 ,有时会将正常的脑转变为患有癫痫的脑 .研究者建立了一组小鼠 ,其脑中相关部分缺失该可疑蛋白 ,即脑衍生神经营养因子 (BDNF) .研究者又建立了另...  (本文共1页) 阅读全文>>

《世界科学技术》2001年05期
世界科学技术

2010年全球基因组市场将会有4000个药靶问世

人类基因组已完成了排序,这个成就无疑影响了制药工业在科学及药物开发领域的发展。决策资源DecisionResources公司的Pharmacor研究报告主要有以下几点发现:·2000年世界医药市场总价值为3170亿美元,到2020年将增加至3万亿美元。驱动这种增长的原因是由基因组技术鉴定的新药靶的涌现。目前约有400个药靶能利用,在未来的10年内,超过4000多个药靶将被采用。·10年间,领先的制药公司将以一种整合战略为其发展的主要特征。这种整合集体中体现在特定的治疗领域或药物种类,技术的合理应用,有效的新药发现与开发过程,完整的知识产权组合,高度灵活的基础结构,与生物技术联盟公司、服务公司和调研公司之间的适当关系等。另一个特征则是把基因组技术应用于公司的研发R&D计划之中。·制药公司正不同程度地把基因组和相关...  (本文共1页) 阅读全文>>