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蛋白质芯片在蛋白质组学研究中的作用

随着人类基因组测序工作的完成,对基因表达 产物蛋白质的研究己成热点。为揭示众多蛋白质的 作用和相互关系,从而真正破解基因功能,以蛋白 质组学为核心的后基因组研究己成为必然趋势【‘}。 由于蛋白质芯片可利用微量生理或生物采样即可同 时检测不同的蛋白质分子和蛋白质分子之间的相互 作用,获得各种条件下蛋白质组的变化,进而得以 对基因的表达情况及基因功能进行深入研究。因 此,在蛋白质组学研究中,蛋白质芯片具有其他方 法难以比拟的优越性。 1蛋白质组研究的主要技术及存在的不足 蛋白质组研究主要包括样品或组织中的蛋白质分 离和分离蛋白质的鉴定两个关键步骤。目前,主要 技术是双相凝胶电泳(tw 0 dimensionalseleleCtrophoresis, ZDGE)和质谱(mass speetrometry,MS)分析。 Ll双相凝胶电泳双相凝胶电泳技术始于1975 年l2],其基本原理:第一,基于蛋白质的等电点不 同,在pH梯度胶内等电...  (本文共5页) 阅读全文>>

新疆医科大学
新疆医科大学

新疆地区肾癌血清肿瘤标志物的筛查及其维、汉民族差异的研究

目的:通过探索新疆地区肾癌患者与健康者之间血清蛋白表达谱的变化,汉族与维吾尔族肾癌患者之间血清蛋白表达谱的变化以及肾癌患者手术治疗前后的血清蛋白表达谱变化,①筛选并建立新疆地区肾癌血清标志物诊断模型;②建立维吾尔族、汉族不同民族肾癌血清诊断模型并筛查两个不同民族肾癌患者之间的差异蛋白;③筛选肾癌术后复发、转移及预后监测指标。方法:采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术和弱阳离子交换蛋白芯片(CM10)检测血清标本,所得到的数据采用浙江大学蛋白质质谱数据分析系统软件包进行分析研究。蛋白质指纹图诊断模型建立是应用支持向量机方法来完成的,模型判别效果的评估采用留一法交叉验证。采用Wilconxon秩和检验进行两组间的蛋白质峰的比较,P<0.05有统计学意义。1)对新疆地区44例健康对照与40例肾癌患者血清蛋白表达谱进行检测分析;2)对新疆地区24例维吾尔族肾癌患者与24例维吾尔族健康对照血清蛋白表达谱进行检测分析;对36例汉族肾癌...  (本文共122页) 本文目录 | 阅读全文>>

青岛大学
青岛大学

蛋白质组学方法检测膀胱移行细胞癌患者尿液中特异性肿瘤标记物

目的 检测膀胱移行细胞癌(transitional cell carcinoma of bladder,TCC)患者尿液中差异表达蛋白质,筛选新的肿瘤标记物,进而探讨其与TCC发病机理的相关性,以及蛋白质组学方法在膀胱移行细胞癌早期无创诊断方面的临床应用价值。方法 选取青岛大学医学院附属医院泌尿外科TCC住院病人尿液标本12例,另外选取4例TCC行经尿道膀胱肿瘤切除术后或膀胱部分切除术后的病人、4例健康志愿者以及4例肾肿瘤病人的尿液标本作为对照。将所收集的尿液标本离心后取上清液,采用蛋白质芯片技术结合表面增强激光解析/离子化-飞行时间-质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)检测各组标本中的差异表达蛋白质,所得数据经计算机形成模拟图谱,再通过Biomark Wizard软件对不同...  (本文共48页) 本文目录 | 阅读全文>>

《国外医学.药学分册》2004年01期
国外医学.药学分册

蛋白质芯片及其在蛋白质组研究中的应用

随着人类基因组大部分测序工作的完成 ,人类基因组计划已经进入后基因组时代———功能基因组时代 ,蛋白质能直接反映基因给予的信息 ,其表达谱比基因表达谱更能真实地反映生物体的功能机制。因此 ,蛋白质及其之间的相互作用越来越引起基础和临床科学家们的关注。研究其组成及性质是揭示基因和疾病连接链条中的关键一环。传统的色谱分离纯化、二维电泳等分析方法难以对蛋白质开展大规模、超微量、高通量、全自动的筛选。蛋白质芯片的诞生为现今蛋白质研究提供了一条发展的高速路。蛋白质芯片可以在同一时相分析整个蛋白质组。通过比较正常状态与疾病状态的蛋白质组 ,科学家们有可能更好地理解信号转导、物质及能量代谢通路[1] 。因此 ,许多科学家认为蛋白质芯片将会缩小存在于基因组与蛋白质组之间的信号鸿沟。1 蛋白质芯片的简介蛋白质芯片 (proteinchip)又称蛋白质微阵列(proteinmicroarray) ,是继基因芯片之后 ,作为基因芯片功能的补充发展起来...  (本文共6页) 阅读全文>>

复旦大学
复旦大学

生物质谱新技术与新方法及其在蛋白质组学中的应用研究

本博士学位论文工作的主要贡献为:在蛋白质组学领域中关于低丰度蛋白和多肽除盐、富集的研究方面取得了创新性的进展:利用液滴内部的“OutwardFlow”过程结合自制的多功能疏水性聚合物成功实现了一步高效靶上除盐与样品富集直接MALDI-MS分析,并成功应用到实际样品的蛋白质组学研究中;同时利用上述体系,使用阳离子型聚合物成功实现了对低丰度磷酸化肽段的靶上富集与除盐;首次利用聚合物-无机纳米复合材料成功实现了低丰度蛋白质/多肽的高效、快速和高回收率富集;参与研制成功了作为高效液相色谱检测器的电喷雾—四极杆—飞行时间质谱仪(ESI-Q-TOF-MS),填补了国内空白。蛋白质组学作为后基因组时代生命科学领域的热点,近年来得到了蓬勃的发展,已涉足生命科学中一系列前沿领域,并成为分析化学研究领域的最前沿课题。它的内容包括分离和分析细胞与组织的全部蛋白并直接找到一组或几组功能蛋白,研究它们与功能基因(组)的内在联系。蛋白质组研究具有观察由多基...  (本文共216页) 本文目录 | 阅读全文>>

山东农业大学
山东农业大学

杨树溃疡病(Botryosphaeria dothidea)典型病斑的蛋白质组学分析

杨树是非常重要的用材林树种。杨树溃疡病是危害杨树枝干的主要病害之一,研究杨树溃疡病的致病机制有重大的经济和生态意义,蛋白质组学作为后基因组时代的新兴研究领域,是当今生物学研究中揭示物质生命现象的重要手段,是林木生物学的重要内容。对杨树溃疡病的典型病斑进行蛋白质组学分析,对阐明杨树溃疡病的致病机制以及杨树的抗病机制有重要的推动作用;也为其他林木与病原菌互作的蛋白质组学研究提供了参考。本研究以野外采集的、9月份发病高峰期的107杨树树皮健康组织和溃疡病斑为实验材料,建立了一种适合杨树树皮的蛋白质提取方法,并运用蛋白质组学方法对杨树与溃疡病菌互作所产生典型病斑的蛋白质进行了分离和分析,对差异表达的蛋白点进行了质谱鉴定和生物信息学分析,主要获得以下研究结果:1.建立了一种适合杨树树皮蛋白质的提取方法,针对蛋白质提取过程中的样品沉淀时间、所加裂解液的量和振荡裂解时间,设置不同梯度,通过实验反复验证,确定了蛋白质提取的最优沉淀时间为12h;...  (本文共62页) 本文目录 | 阅读全文>>