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群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析

群体遗传结构是指遗传变异在物种或群体中的一种非随机分布 ,即遗传变异在群体内、群体间的分布样式以及在时间上的变化 (Hamrick&Loveless ,1989)。这种非随机分布是由不同过程共同作用产生的 ,包括物种长期的进化历史 (分布区改变、生境破碎、群体隔离 )、突变、遗传漂变、繁育系统、基因流与选择 (Slatkin ,1987;葛颂 ,1997;Schaaletal .,1998)。因此 ,要阐明生物进化的过程、式样和机理 ,必须首先探讨生物群体遗传变异大小、遗传结构及其变化规律以及影响群体遗传结构的各种因素(Hamrick ,1983;葛颂 ,1994 ,1997)。群体遗传结构的研究也是遗传资源利用和物种保护的基础 (葛颂 ,1997;李昂 ,葛颂 ,2 0 0 2 )。在研究群体遗传结构时 ,Wright (195 1,196 5 )提出的F statistics是广泛采用的模型 (Weir ,1990 ;Rou...  (本文共7页) 阅读全文>>

《水产学报》2005年01期
水产学报

用AFLP方法分析中国对虾抗病选育群体的遗传变异

中国对虾(Fenneropenaeuschinensis),属于对虾科(Penaeidae),明对虾属(Fenneropenaeus),主要分布于我国黄海、渤海以及朝鲜半岛沿海,是我国北方重要的渔业对象及海水养殖虾类[1]。近年来,由于过度捕捞、栖息地生态环境污染等因素,中国对虾的自然资源在迅速衰减[2],因此对虾养殖业的地位日益突出。但是病害问题一直困扰着对虾养殖业,另外,“野捕家养”的苗种供应系统也不能满足对虾健康养殖可持续发展的需要。培育优质高产抗逆的品种,是对虾养殖业迫切需要解决的问题。我国自1998年起开始人工选育抗病性强的群体,至今已获得抗病对虾群体第四代,其抗病性明显提高[3]。但是伴随人工选育过程,经常发生近交几率增加,有效群体数目减少等,有可能导致遗传变异降低,从而遗传响应减少[4]。因此,有必要对其遗传变异进行检测,从分子水平了解其遗传结构的变化,以制订相应的科学措施从而保证育种工作顺利进行。AFLP(amp...  (本文共7页) 阅读全文>>

《Chinese Science Bulletin》2006年04期
Chinese Science Bulletin

GENETIC DIVERSITY AMONG CHINESE SIKA DEER (CERVUS NIPPON) POPULATIONS AND RELATIONSHIPS BETWEEN CHINESE AND JAPANESE SIKA DEER

SIKA DEER,CERVUS NIPPON,WAS HISTORICALLY WIDE-SPREAD THROUGHOUT NORTHEASTERN ASIA,FROM THE USSURI REGION TO VIETNAM,INCLUDING THE KOREAN PENINSULA,MAINLAND CHINA AND TAIWAN,AND THE JAPANESE ARCHI-PELAGO,AND UP TO13SUBSPECIES HAVE BEEN DESCRIBED[1].THE FOSSIL RECORD INDICATES THAT THE SIKA DEER ORIGINATED DURING THE LATE PLIOCENE OR EARLY PLEISTOCENE AND THEIR ANCESTORS WERE DISTRIBUTED ACROSS MOST OF CHINA DURING THE...  (本文共8页) 阅读全文>>

《热带生物学报》2016年04期
热带生物学报

九孔鲍5个家系遗传多样性的AFLP分析

鲍鱼口感细嫩、营养丰富,被誉为海味八珍之首,20世纪60年代末,我国开始进行鲍鱼养殖研究,目前,已发展成为世界第1养鲍大国[1]。九孔鲍(Haliotis diversicolor supertexta)分布在我国台湾沿海,因其生长速度快、品质优良,1989年被引进大陆,在南方沿海得到广泛养殖。近年来,九孔鲍养殖出现生长速度减慢、个体趋小、抗逆性差、死亡率高等问题[2],对我国鲍鱼养殖业的健康持续发展造成了严重影响。长期近亲繁殖导致的遗传退化可能是导致这些问题的主要原因[3]。为了解决上述问题,普遍采用群体选育、杂交育种等方法对九孔鲍现有养殖群体进行种质改良,而正确选择遗传背景丰富的亲本是育种成败的关键,因此,在制定选育计划时,首先应分析群体的遗传多样性,以判断其是否适合选育和养殖[4]。扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP)技术在结合RAPD和RFLP优点的...  (本文共5页) 阅读全文>>