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新成人腹泻轮状病毒J19株NSP1、NSP2和NSP3基因序列分析

1994、1997年,分别在我国北京、河北省等地发现与新轮状病毒核酸电泳图型一样的轮状病毒,该病毒在北京、河北等地造成两次大规模的成人病毒性腹泻的暴发。由于它的核酸电泳图型和血清学分析与已发现的引起成人腹泻的轮状病毒明显不同而称为新成人轮状病毒(novel adult diarrhearotavirus)[1]。该病毒用原代人胚肾细胞分离培养成功,分离培养成功的病毒被称为新成人腹泻轮状病毒J19株[1]。在上述研究的基础上,本研究拟对J19株非结构蛋白NSP1、NSP2和NSP3进行基因克隆和序列分析,现报道如下。1材料和方法1.1病毒、质粒和细菌菌株新成人腹泻轮状病毒J19株分离自河北省石家庄市腹泻患者的粪便标本;pMD18-T载体购买自大连宝生物公司;大肠埃希菌JM109由本实验室保存。1.2试剂丙烯酰胺、甲叉双丙烯酰胺、Polyethylene glycol(PEG)(6000#)购自美国Sigma公司;RNase T1购...  (本文共3页) 阅读全文>>

《石油与天然气地质》2015年01期
石油与天然气地质

三角洲前缘水下分流河道单砂体叠置机理及对剩余油的控制——以扶余油田J19区块泉头组四段为例

我国东部大多数老油田,经过多年的注水开发,已进入高含水开发阶段[1],剩余油分布情况十分复杂,呈高度分散状态。常规的基于小层精度的储层研究已经难以满足油田生产需要,研究重心以由小层为基本单元深入至以复合河道砂体内部单砂体为基本单元。单砂体是指自身垂向上和平面上都连续,但与上、下砂体间有泥岩或不渗透夹层分隔的砂体[2-5]。不同的单砂体在粒度、分选、杂基含量等方面存在较大差异,从而导致储层物性方面有较大差异;而且单砂体之间经常存在较薄的泥岩、泥质粉砂岩或泥质细砂岩隔夹层,导致单砂体之间不连通,从而使复合河道砂体含油不均匀[6-17],使得储层非均质性愈加严重,增加了老油田剩余油挖潜工作的难度。1研究区概况扶余油田泉头组四段(泉四段)沉积时期盆地持续坳陷,来自西南方向的保康水系和南部的怀德-长春水系为主要物源,多条河流向湖盆注入,形成了大面积的浅水三角洲砂体[18],以乾安三角洲和扶余三角洲为典型代表。泉四段坳陷期沉积的地层厚度介于...  (本文共8页) 阅读全文>>

《中华微生物学和免疫学杂志》2006年09期
中华微生物学和免疫学杂志

一种改良方法克隆新的成人腹泻轮状病毒J19株的大片段基因

轮状病毒是人类和动物的重要致病因子。分析病毒的基因序列对于监测病毒的流行、变异以及疫苗的开发都具有重要作用。虽然克隆轮状病毒基因的技术在不断进步,克隆大的轮状病毒基因片段仍然存在问题,尤其是在病毒核酸的样品量小或病毒基因序列不清楚的情况下。现在克隆轮状病毒基因主要采用下面两种方法:第一种方法是基于基因组双链RNA(dsRNA)的加尾、特定引物引导的逆转录、克隆或采用随机引物逆转录、克隆〔’司。这类方法不仅技术复杂,而且还因操作步骤多而导致克隆基因的效率低闲。第二种克隆方法是基于cDNA的PcR扩增,这使得从少量起始材料克隆成为可能。开始,该方法仅用于扩增已知病毒基因序列。研究克隆未知轮状病毒基因方法的里程碑是针对不能培养的轮状病毒而设计出的非依赖核酸序列的单引物扩增法川。然而,开始时该方法仅能克隆dsRNA小于1.5比的完整片段图。后来,虽然对该方法进行了改进,可是使用该方法克隆轮状病毒大于2肠以上的基因片段仍然较困难低幻。在非...  (本文共5页) 阅读全文>>

《中华微生物学和免疫学杂志》2006年08期
中华微生物学和免疫学杂志

成人腹泻轮状病毒J19株依赖RNA的RNA聚合酶基因序列分析

轮状病毒是人类和动物病毒性腹泻的重要病原。轮状病毒为双链R刊A(击BNA)病毒,含有n个分节段的击RNA。根据病毒分组抗原蛋白VP6的特异性,轮状病毒一般分为7个组(A一G);其中A、B以及C组病毒人群和动物中皆有发现,而其他各组的轮状病毒目前仅在动物中发现。在中国,除暴发婴幼儿腹泻外,还暴发过由成人腹泻轮状病毒(adult Uiullll皿6,‘月已任u〔i儿‘口二“Uyol。diorl如ea双成avlrus列今DRV)引起的流行,患者累计上百万人〔‘川。该病毒于1983年在世界上首次发现,它的感染对象没有年龄限制,但是感染者主要是成年人,故该病毒被定名为成人腹泻轮状病毒,归类为B组川。1987、1988年在我国湖南省和福建省分别发现病毒核酸的聚丙烯酞胺凝胶电泳图型与ADRV的核酸电泳图型不同的新轮状病毒。1994和1997年,分别在我国北京、河北省又发现该病毒引起成人腹泻暴发。由于它的核酸电泳图型和血清学分析结果与成人腹泻轮...  (本文共4页) 阅读全文>>

《中华微生物学和免疫学杂志》2006年04期
中华微生物学和免疫学杂志

新的成人腹泻轮状病毒J19株NSP4和NSP5基因克隆和序列分析

轮状病毒属于呼肠病毒科,它的基因组由n条 双链RNA(dsRNA)构成。根据轮状病毒分组抗原蛋 白VP6的抗原特异性,轮状病毒被划分为A一G7 个组,其中A、B和c组能感染人,其他组病毒仅在 动物中发现。轮状病毒是世界范围内婴幼儿腹泻的 最重要的病原,估计每年有1 .3亿的婴幼儿感染该 病毒。可是,在中国,除暴发婴幼儿腹泻外,还发生 过由成人腹泻轮状病毒(aduh dian通leall〕taviI’us,AD- Rv)引起的局部流行,患者累计上百万人〔‘一3〕。1987 和1988年在我国湖南省和福建省分别发现病毒核 酸的聚丙烯酞胺凝胶电泳图型与我国以前发现的成 人腹泻轮状病毒的核酸电泳图型不同的新轮状病 毒。1994和1997年,又分别在我国北京、河北省发 现与上述新轮状病毒核酸电泳图型一样的轮状病 毒,并且该病毒在上述两地造成两起大的成人腹泻 的暴发。由于它的核酸电泳图型和血清学分析结果 中华微生物学和免疫学杂志2以拓年4月...  (本文共4页) 阅读全文>>

《病毒学报》2006年03期
病毒学报

新成人腹泻轮状病毒J19株VP2、VP3的编码基因序列分析

轮状病毒是人类和动物病毒性腹泻的重要病原。根据病毒分组抗原蛋白VP6的特异性,轮状病毒一般分为7个组(A~G);其中A、B和C组病毒在人群和动物中皆有发现,而其它各组的轮状病毒仅在动物中发现[1]。目前在人群中流行的轮状病毒一般为A组轮状病毒,该组病毒每年都造成大量的婴幼儿腹泻。在中国,除暴发婴幼儿腹泻外,还暴发过由成人腹泻轮状病毒(Adult diarrhea rotavirus,ADRV)引起的大流行,患者累计上百万人[2-4]。该病毒于1983年在世界上首次发现,并证明它与一般轮状病毒不同,感染对象没有年龄限制,因为大部分感染者为成年人,故该病毒被定名为成人腹泻轮状病毒,归类为B组[4]。1987年、1988年在我国湖南省和福建省分别在腹泻病原调查中发现病毒核酸的聚丙烯酰胺凝胶电泳图型与成人腹泻轮状病毒的核酸电泳图型不同的新轮状病毒。1994年和1997年,又分别在我国北京、河北省等地发现与上述病毒的核酸电泳图型一样的轮状...  (本文共4页) 阅读全文>>