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小麦Tamlo基因家族成员片段的克隆

小麦白粉病是小麦生产中最严重的病害之一,在全国小麦的各主要产区均有发生。国内外许多学者就麦类作物抗白粉病的组织细胞病理学及小种专性抗性的分子生物学都进行了较为深入的研究,并且随抗条锈育种育成的Pm基因系列小麦品种可抗个别白粉菌株系,但就广谱免疫或近免疫型抗病方面还缺乏系统研究及有效的基因资源。本文采用异源基因克隆策略,设计了多对上、游引物进行组合,提取小麦总RNA,利用RT-PCR方法,从小麦叶片组织中克隆到组成型表达的Tamlo基因家族成员的片段两个,长度均为513bp,分别命名为Tamlo1、Tamlo2。经BLAST基因数据库查明是小麦中的新基因,其结果如下:与大麦mlo基因碱基的同源性均达到90%以上,其中Tamlo1为92.7% ,Tamlo2为91.4%;与大麦MLO蛋白序列的同源性也达到了90%以上,其中Tamlo1为90.8%,Tamlo2为90.1%。将两个基因片段在Genebank上登录,分别取得登录号为AF  (本文共47页) 本文目录 | 阅读全文>>

《世界华人消化杂志》2008年23期
世界华人消化杂志

再生基因家族与消化系统肿瘤

■背景资料再生基因家族自被发现以来,就其在糖尿病、炎症创伤和肿瘤尤其是消化系肿瘤中的作用的研究越来越多.0引言再生基因(regenerating gene,Reg)家族自1988年被发现以来,其在糖尿病、炎症创伤和肿瘤尤其是消化系肿瘤中的作用越来越受到重视.Reg家族的作用最早是在糖尿病的研究中发现的.目前知道Reg家族可促进胰岛细胞的增殖,改善糖尿病病鼠的疾病状态.近年来随着研究的深入,Reg家族在肿瘤中的重要作用逐渐被人们所注意.Reg家族尤其是RegⅠ和RegⅣ在消化系统肿瘤中表达明显上调,可能起到癌基因的作用,并可能作为肿瘤的重要标志物而应用于临床,但Reg家族在肿瘤的发生发展中的确切机制还在进一步的研究中.1再生基因家族Reg家族属钙依赖的植物血凝素超家族,他代表一组分泌蛋白,其功能相当于急性反应蛋白、抗凋亡因子或胰腺β细胞和神经细胞的分泌因子[1].根据Reg基因编码蛋白的一级结构,Reg家族可分为四个亚型(Ⅰ、Ⅱ、...  (本文共5页) 阅读全文>>

中国农业科学院
中国农业科学院

水稻转化酶基因家族的进化及其在干旱胁迫下的表达调控

转化酶(EC 3.2.1.26)是蔗糖代谢中的关键酶,它催化蔗糖不可逆水解成葡萄糖和果糖。在高等植物中有两个不相关的基因家族参与合成转化酶的所有同功酶:酸性转化酶基因家族(位于细胞壁和液泡)和中性/碱性转化酶基因家族(被认为在细胞质中)。这里,以水稻品种IR64为材料确认了水稻的三组不同的转化酶基因:一个细胞壁组(OsCIN1-9),一个液泡组(OsVIN1-2)和两个古老的中性/碱性组(α组,OsNIN1-4;β组OsNIN5-8),并在基因序列分析的基础上推测出编码蛋白的亚细胞位置,同时在内元-外元结构、基因复制与丢失以及转录表达等多个方面系统研究了酸性转化酶和中性/碱性转化酶基因家族的进化。不同于结构相对保守的中性/碱性转化酶家族,酸性转化酶家族在进化过程中经历了多次内含子丢失,而且在转录上也显示了较大的时空表达的多样性。本研究重点分析了酸性转化酶基因家族多样性的可能原因。合成果聚糖的酶被认为是由液泡转化酶进化而来,那么水...  (本文共99页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国科学院研究生院(植物研究所)
中国科学院研究生院(植物研究所)

水稻中一个编码富含脯氨酸蛋白基因家族的表达和功能研究

OsPRP1是水稻中特有的,编码一类富含脯氨酸蛋白(proline-rich protein, PRP)的基因家族,该家族有4个成员。在GenBank中,仅找到了一个结构相对接近的玉米PRP蛋白,但是对它的研究仅限于序列上的某些描述,而且在序列上,仍然与这4个OsPRP1蛋白有明显的差别。OsPRP1蛋白明显有别于前人(1999)所描述的4类PRP蛋白。它们是植物中一类新的小分子量的PRP蛋白,仅有一个保守结构域而属于DUF1210蛋白超家族的成员。四个OsPRP1基因在基因组中紧密串联排列,而且编码区高度保守,基因结构也高度一致,证明它们来源于同一个祖先基因,是通过基因复制的方式产生的。PAML分析也证明它们在进化时间上的相互距离并不远。而在进化过程中由于执行生理功能上的某种重要性,在编码区表现出很的保守性,因而很难在RNA水平和蛋白水平上研究四个OsPRP1基因的表达差异。但是它们在表达调节区(如启动子区)显示出明显的差异。...  (本文共106页) 本文目录 | 阅读全文>>

浙江大学
浙江大学

基于生物信息学方法分析基因家族及非编码序列的研究

水稻(Oryza sativa L.)是世界上最主要的粮食作物之一,为世界一半以上的人口提供主粮。水稻分为两个亚种,即籼稻和粳稻。现在水稻的两个亚种(93-11和日本睛)的基因组草图已公布。另外,日本晴的1号,4号和10号染色体的精细图也已完成。拟南芥的基因组相对较小,是植物遗传学研究的一个模式植物。2000年下半年,拟南芥成为第一个全基因组测序完成的植物。本论文的研究目的是从改良作物的抗病和抗旱两大重要的育种目标出发,对水稻抗病和抗旱两大基因家族的基因的分布,表达和调控进行了分析。我们根据抗病基因结构功能域的保守性,改进了抗病基因类似物(RGA)多态性标记。同时,根据内含子序列变异大,而外显子变异较小开发了内含子长度多性标记;且对长非编码序列、短非编码序列和特殊序列进行研究,从而了解植物基因的表达调控。本论文采用生物信息学的方法和结合水稻和拟南芥的基因序列,围绕上述提出的几大研究目的,对当前作物遗传育种中的几大研究问题进行深入...  (本文共86页) 本文目录 | 阅读全文>>

中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)
中国科学院研究生院(上海生命科学研究院)

拟南芥中ASYMMETRIC LEAVES2与其它极性基因之间的遗传调节关系及其在极性建成中作用的分子机制

拟南芥ASYMMETRIC LEAVES2 (AS2)基因在叶发育过程中起到调节近轴面极性建成的作用。由PHABULOSA (PHB)、PHAVOLUTA (PHV)和REVOLUTA (REV)组成的PHAB基因家族、AS1和AS2共同作用于近轴面极性建成。KANADI (KAN)和YABBY (YAB)基因在远轴面极性建成中起作用。现在已知这些基因共同作用于叶片的近-远轴极性建成,但是AS2同其它极性基因之间的遗传调节关系并不清楚。为了弄清这个问题,我们对极性基因的单突变和双突变进行了表型分析和遗传分析。分析结果表明AS2正调节PHB和REV基因的表达,但与KAN基因之间可能不存在直接的遗传调节关系。AS2可能通过两种机制作用于叶片近轴面极性建成:第一种是通过调节PHAB基因作用于近轴面极性建成,第二种是不通过PHAB基因而直接作用或通过其它未知途径调节近轴面极性建成。分析结果还证明,虽然PHAB基因共同作用于近轴面极性建成...  (本文共80页) 本文目录 | 阅读全文>>