我国发现稻米品质控制基因调控网络
本报讯 中国科学院院士李家洋领导的研究团队12月14日在新一期美国《国家科学院学报》上发表论文说,他
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- 中国卫生统计
基因调控网络(gene regulatory network,GRN)是当前功能基因组学所研究的重要内容之一,作为一种描述基因间相互作用关系的方式,在推断复杂疾病的致病原理过程中发...
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- 新疆大学学报(自然科学版)
考虑了具有变时滞的随机基因调控网络指数稳定性问题,采用了Lyapunov泛函的方法和Halanay-type不等式技巧...
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- 中国卫生统计
目的 讨论利用模糊相关系数建立基因调控网络。并从理论和实际应用的角度和其他相关系数方法进行相互比较。方法 以基因表达数据矩阵为出发点 ,用相关系数描述基因之...
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- 华中师范大学
表观遗传的基因调控是指不改变DNA序列的前提下在转录和转录后水平上对基因表达的控制。在生物系统中各种基因表达产物之间互相作用,形成庞大而又极为复杂的基因调控网络。对基因调控网络尤其是核心网络模体的动力学行为和调控机制的研究已经成为当前系统生物学和生物信息学的热点。生物系统中的调控受到许多随机非线性因素的影响,如生命活动中由于参与生化反应的分子个数非常少而引起的明显涨落,细胞所处的微环境中随机扰动因素,基因调控中信号传递的时滞影响等,因此,在基因调控网络的研究中必须充分考虑非线性随机动力学因素的影响。本文基于非线性随机动力学理论以及数值模拟技术,系统研究了体细胞重编程过程中级联前馈型基因调控模型和肺癌细胞表型转变的双负反馈调控模型,取得的成果如下:(1)本文基于描述体细胞重编程过程的具有与门的级联前馈非线性动力学模型,在外源多能因子连续表达条件下,对细胞内各关键基因表达量的数值模拟结果能与体细胞重编程实验中各多能因子激活的延迟效应...
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- 哈尔滨工业大学
生物的生长发育、形态、对内外部环境的响应均受到生物内在的复杂生物网络控制。在基因层面上,基因调控网络反映了生物系统中各类元件在基因层面的相互作用关系。基因调控网络重构的研究对人们解析复杂性状的遗传构成和调控机制起到重要的作用,是系统生物学、生物信息学中极具挑战性的前沿课题。近年来,面对日益增长的粮食需求,使得从生物信息学角度出发,研究发现控制优质农艺性状的关键基因和关键性状的多基因遗传调控网络的计算方法成为该领域重要的研究课题。为此,本文以模式生物拟南芥、水稻为对象,以基因调控网络构建算法为主线,主要对候选基因识别、网络重构算法、数据方法等问题进行了深入研究。主要研究内容包括以下四个方面:第一,研究了单一时序表达谱数据中差异表达基因的识别及排序方法。当前生物数据的获取与筛选成本高昂,使用计算方法完成差异表达基因的识别与候选基因排序能有效地推动基因调控网络构建的研究。本文提出了一种基于平滑基因过滤器和样条曲线拟合的差异表达基因识别...
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