我科学家发现肝细胞癌精准治疗的潜在新靶点
本报北京2月28日电(记者袁于飞)英国《自然》杂志28日凌晨在线发表我国科学家在基础研究领域的一项重大科
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- 中国普外基础与临床杂志
目的探讨丙肝相关肝细胞癌(HCV-HCC)和乙肝相关肝细胞癌(HBV-HCC)的基因表达差异及其潜在的分子机制。方法从公共基因表达数据库下载并整合HCV-HCC和HBV-HCC基因表达矩阵并使用limma包对HCV-HCC和HBV-HCC样本的基因表达水平进行差异分析并确定差异表达基因(DEG);通过基因集富集分析(GSEA)探讨HCV-HCC和HBV-HCC间抑制或激活的基因集差异;使用MCODE筛选出得分最高的关键分子模块及其内的关键基因;通过clusterProfiler包对关键基因的基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以了解关键分子模块潜在的生物学过程和分子通路;同时利用Kaplan-Meier Plotter数据库评估关键基因对HCC患者总生存情况的影响。结果本研究中共获得HBV-HCC样本119例、HCV-HCC样本16...
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- 微生物学报
尽管肝细胞癌和肠道微生物群落之间的关系已得到实验和临床证实,但目前这些关系在指导临床诊断和治疗上的应用仍十分罕见。本文就肠道微生物群落与肝细胞癌的关系及其在肝细胞癌诊断中的...
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- 昆明医科大学学报
由于肝细胞癌的发生与发展机理复杂,目前还未充分揭示。作为人体基因组中规模最大的转录因子家...
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- 临床肝胆病杂志
生物信息学是一门交叉科学,通过综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量生物数据所包含的生物学意义。随着基因组学测序技...
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- 现代肿瘤医学
目的:寻找与肝癌发病机制和预后相关的潜在代谢基因并构建预测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者预后模型。方法:通过GSEA数据库获得所有与代谢途径相关的基因,从TCGA数据库下载肝癌和正常组织的基因表达数据。将二者的基因相映射,分析这些代谢差异表基因(DEGs)在肝癌标本中的表达情况。然后用单因素Cox回归分析筛选与预后相关的代谢基因。在此基础上,使用LASSO分析进一步筛选预后基因,构建预后风险模型,分析高、低风险组预后情况。并对预后模型中的基因进行KEGG通路富集分析和GO分析。采用单因素Cox分析和多因素Cox回归分析,对预后模型进行独立预后分析,同时绘制Nomogram...
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