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肝细胞癌标志物研究获新进展

本报讯(记者王 丹 管九苹)近日,北京大学肿瘤医院研究人员及其合作者发现并证明α2δ1是肝细胞癌肿瘤干细  (本文共1页) 阅读全文>>

权威出处: 健康报2013-05-10
《中国普外基础与临床杂志》2021年12期
中国普外基础与临床杂志

基于生物信息学分析丙肝和乙肝相关肝细胞癌的基因组学差异

目的探讨丙肝相关肝细胞癌(HCV-HCC)和乙肝相关肝细胞癌(HBV-HCC)的基因表达差异及其潜在的分子机制。方法从公共基因表达数据库下载并整合HCV-HCC和HBV-HCC基因表达矩阵并使用limma包对HCV-HCC和HBV-HCC样本的基因表达水平进行差异分析并确定差异表达基因(DEG);通过基因集富集分析(GSEA)探讨HCV-HCC和HBV-HCC间抑制或激活的基因集差异;使用MCODE筛选出得分最高的关键分子模块及其内的关键基因;通过clusterProfiler包对关键基因的基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以了解关键分子模块潜在的生物学过程和分子通路;同时利用Kaplan-Meier Plotter数据库评估关键基因对HCC患者总生存情况的影响。结果本研究中共获得HBV-HCC样本119例、HCV-HCC样本16...  (本文共8页) 阅读全文>>

《微生物学报》2021年11期
微生物学报

肠道微生物在肝细胞癌发生发展中的作用机制及其作为诊断指标的可行性(英文)

尽管肝细胞癌和肠道微生物群落之间的关系已得到实验和临床证实,但目前这些关系在指导临床诊断和治疗上的应用仍十分罕见。本文就肠道微生物群落与肝细胞癌的关系及其在肝细胞癌诊断中的...  (本文共12页) 阅读全文>>

《昆明医科大学学报》2022年01期
昆明医科大学学报

锌指蛋白与肝细胞癌的研究进展

由于肝细胞癌的发生与发展机理复杂,目前还未充分揭示。作为人体基因组中规模最大的转录因子家...  (本文共6页) 阅读全文>>

《临床肝胆病杂志》2022年01期
临床肝胆病杂志

生物信息学在肝细胞癌风险预测中的应用

生物信息学是一门交叉科学,通过综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量生物数据所包含的生物学意义。随着基因组学测序技...  (本文共5页) 阅读全文>>

《现代肿瘤医学》2022年05期
现代肿瘤医学

基于生物信息学分析筛选和鉴定肝细胞癌预后相关的代谢基因

目的:寻找与肝癌发病机制和预后相关的潜在代谢基因并构建预测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者预后模型。方法:通过GSEA数据库获得所有与代谢途径相关的基因,从TCGA数据库下载肝癌和正常组织的基因表达数据。将二者的基因相映射,分析这些代谢差异表基因(DEGs)在肝癌标本中的表达情况。然后用单因素Cox回归分析筛选与预后相关的代谢基因。在此基础上,使用LASSO分析进一步筛选预后基因,构建预后风险模型,分析高、低风险组预后情况。并对预后模型中的基因进行KEGG通路富集分析和GO分析。采用单因素Cox分析和多因素Cox回归分析,对预后模型进行独立预后分析,同时绘制Nomogram...  (本文共10页) 阅读全文>>