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越冬白头鹤肠道微生物群落结构组成的时空变化及其影响因素的研究

肠道微生物在机体维持健康中发挥重要的作用,其群落组成受到内源和外源因素的影响。内源因素包括遗传、性别等因素;外源因素包括季节、空间等环境因子。鸟类由于具有飞翔能力,可以大范围、远距离传播和扩散微生物,因此其肠道微生物的研究倍受关注,特别是集群水鸟的肠道微生物研究已经成为关注的热点。迁徙水鸟肠道微生物多样性及其维持机制和功能解释将成为水鸟生态学研究的一个重点领域。本文以长江中下游流域的升金湖和菜子湖的越冬白头鹤(Grus monacha)为对象,采用非损伤技术获得粪便样品,并提取寄主粪便的总DNA,通过高通量测序技术(Illumina HiSeq)平台,进行16S rRNA高变区的PCR扩增测序,并进行生物信息学的分析,研究地理格局、季节动态、环境等因素对寄主肠道微生物群落复合体结构和功能的影响,阐明越冬白头鹤肠道微生物群落的组成特点和功能的响应。并取得以下主要结果:(1)越冬白头鹤肠道微生物优势微生物群落的组成主要由厚壁菌门(F  (本文共120页) 本文目录 | 阅读全文>>

东北林业大学
东北林业大学

东北虎肠道微生物的宏基因组学研究

东北虎(Panthera tigris altaica)是世界上最濒危的物种之一,其肠道内存在的微生物群落是长期协同进化的结果,对东北虎的健康和生存有重要影响。为了解圈养东北虎和野生东北虎肠道微生物群落的组成结构和潜在功能,阐明在圈养和野生条件下东北虎肠道微生物群落组成和功能的差异,探究食物、药物等因素对圈养东北虎肠道微生物群落组成和功能的影响,本文结合宏基因组测序、16S rDNA测序和代谢组分析,全面地研究圈养东北虎和野生东北虎肠道微生物群落的组成和功能,深入分析圈养东北虎与野生东北虎、东北虎与其他动物肠道微生物群落组成和功能的差异,并探究母乳喂养和山羊奶喂养对东北虎幼虎肠道微生物群落组成和功能的影响,以及芬苯达唑和伊维菌素片对圈养东北虎肠道菌群多样性和代谢功能的影响,为进一步研究东北虎肠道微生物奠定基础,为促进东北虎的保护与管理提供理论依据。研究结果总结如下:1.基于宏基因组学的圈养和野生东北虎肠道微生物群落组成和功能的研...  (本文共108页) 本文目录 | 阅读全文>>

重庆医科大学
重庆医科大学

社会挫败与人源化抑郁模型的系统生物学研究

第一部分社会挫败应激致大鼠前额叶代谢物改变抑郁症是一种以情绪低落和快感缺失为主要特征的严重精神疾病。目前,社会压力在抑郁症发生和发展中所发挥的具体作用尚不明确。因此,我们使用慢性社会挫败应激模型来诱导大鼠的抑郁样行为,并采用气相色谱-质谱法测量大鼠前额皮质代谢物的变化。在社会挫败周期结束的第一周内,我们先后进行了糖水偏好试验(Sucrose Preference Test,SPT)、旷场试验(Open Field Test,OFT)、高架十字迷宫(Elevated Plus Maze,EPM)和强迫游泳试验(Forced Swim Test,FST),用于评估大鼠的抑郁和焦虑样行为。在代谢物分析中,应用多元统计方法观察所有样本的分布情况,并将社会挫败组与对照组区分开来。利用IPA(Ingenuity Pathway Analysis)软件探索不同代谢产物之间的潜在关系。OFT和EPM在两组之间没有显著差异。在SPT和FST中,社...  (本文共99页) 本文目录 | 阅读全文>>

四川农业大学
四川农业大学

肠道微生物及其与营养互作对猪骨骼肌表型及代谢的调控

骨骼肌表型肌内脂肪和肌纤维特性是影响猪肉食用品质的主要决定因素。最近肠道微生物在宿主生理功能中的重要作用已被破译,但不同品种猪骨骼肌表型差异与肠道微生物的关系尚不清楚。营养与肠道微生物互作对骨骼肌表型的影响还未见报道。本研究通过四个试验,研究了猪品种、猪源菌群移植和断奶后抗生素干预对肠道菌群结构和骨骼肌表型及代谢的影响,并进一步探讨了不同肠道微生物组成的猪对饲粮淀粉类型的响应,为深入认识营养-微生物-宿主互作规律提供试验依据。试验一不同品种猪肠道微生物和骨骼肌表型及代谢的差异本试验旨在比较不同品种猪(荣昌猪和大白猪)菌群结构和骨骼肌表型及代谢的差异。选取12周龄的荣昌猪和大白猪各5头,饲喂不含抗生素的相同饲粮。试验期共56天。结果表明:1)与大白猪相比,荣昌猪肥肉率较高而瘦肉率较低(P0.05)。3)抗生素处理有提高仔猪血清甘油三酯的趋势(P=0.08);显著提高仔猪背肌肌内脂肪含量(P0.05)。4)抗生素处理显著降低仔猪背肌...  (本文共152页) 本文目录 | 阅读全文>>

北京协和医学院
北京协和医学院

全身型幼年特发性关节炎的肠道微生物结构特征研究

目的:幼年特发性关节炎(Juvenile idiopathic arthritis,JIA)是儿童时期最常见的慢性风湿性疾病。全身型JIA(Systemic-onset JIA,SoJIA)是其最严重的亚型之一。尽管SoJIA的发病机制尚不清楚,但最近一些研究表明肠道菌群失调与JIA之间存在相关性,了解SoJIA肠道微生物组特点有助于了解SoJIA的发病机制,为治疗甚至预防疾病的提供新的思路。本研究旨在探讨全身型幼年特发性关节炎(SoJIA)的肠道微生物特征,并评估其肠道微生物与临床指标之间的相关性。方法:本研究为一项单中心病例对照研究。连续入组2017年7月至2018年12月就诊于北京协和医院的SoJIA儿童,同期招募健康儿童作为对照组。SoJIA儿童在来医院就诊时采集新鲜粪便样本并收集临床资料,根据Wallace标准将SoJIA患儿分为活动组或非活动组。提取粪便基因组DNA,扩增其16S rDNA的V4区,并应用Illumi...  (本文共76页) 本文目录 | 阅读全文>>

四川农业大学
四川农业大学

肠道微生物与宿主免疫应答及其互作机制

作为机体的“第二器官”,微生物在宿主免疫调节中扮演着重要角色,但肠道微生物与宿主免疫应答的关系及作用机制仍不明确。本研究以猪和小鼠为动物模型,旨在探明肠道微生物与宿主免疫功能的关系及其可能互作机制,为深入认识肠道微生物与宿主健康的关系及研发动物肠道保健技术积累理论依据。试验一不同品种猪肠道微生物与免疫机能的差异及通过菌群移植对无菌小鼠的影响本试验旨在比较约克猪和藏猪肠道微生物组成及部分免疫表型的差异,并考察菌群移植对无菌小鼠的影响。试验选取健康的纯种约克猪和藏猪各5头,饲喂不含抗生素的相同饲粮56天后收集粪便用于检测菌群结构,并制备菌群悬液,-80℃保存用于菌群移植。取脾脏和大肠,称重并计算脾脏指数与大肠指数,同时取结肠样本用于细胞因子测定。而后选取健康状况良好16只1日龄无菌BALB/C小鼠随机分为2个处理(n=8),分别接种约克猪和藏猪菌群悬液,并于28天后采集粪样,脾脏和大肠样本用于测定肠道菌群结构,脾脏指数,大肠指数和细...  (本文共139页) 本文目录 | 阅读全文>>