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若干模式生物基因组中ORF、Intron和Exon的识别与特征研究

本文主要研究了几类模式生物,包括:大肠杆菌、酵母(Yeast和Pombe)、线虫、拟南芥、果蝇和人类的基因组。目的是寻找一种方法来区分这些模式基因组的编码区和非编码区序列,研究基因的结构以及基因外显子和内含子的识别,简单模式生物中ORF(开放阅读框架)的组织。在大体了解了研究背景,简单回顾了目前基因识别和预测的现状,并简明介绍了论文中相关参数的定义后,论文的后四个部分具体介绍了我们的主要工作。第四章中,通过对序列数据的统计分析,我们得到酵母基因组中基因识别和ORF组织的一些规则,包括:1) 随机框架规则-六类阅读框架W1,W2,W3,C1,C2和C3在DNA双链上被ORF随机采用。同时,也讨论了ORF的重叠现象。2)第一ATG规则—ORF起始于上游的终止密码子(TAA,TAG或TGA)后第个同框架的ATG。遵守这一规则的ORF在酵母基因组中占99.7%。3)ORF碱基分布的非均匀规则—ORF的编码能力和密码子三个位点上四种碱基的  (本文共82页) 本文目录 | 阅读全文>>

《中国老年学杂志》2007年08期
中国老年学杂志

老年人MBL基因ExonⅠ点突变频率及其血浆含量变化的研究

目的探讨老年人甘露糖结合凝集素(MBL)基因ExonⅠ52、54和57位密码子点突变频率和血浆MBL含量变化。方法采用PCR-SSP法检测MBL基因ExonⅠ52位密码子点突变,PCR-RFLP法检测54和57位密码子点突变;ELISA法测定血浆MBL含量。结果老年组和中青年组52、54和57位密码子基因突变频率分别为0.6%和0.8%(确切概率P=...  (本文共3页) 阅读全文>>

《南方农业学报》2016年09期
南方农业学报

MTNR1A基因ExonⅡ T/C突变与绵羊季节性繁殖的关联性分析

【目的】分析MTNR1A基因ExonⅡT/C突变与绵羊季节性繁殖性状的关联性,为深入研究MTNR1A基因在绵羊繁殖活动中的作用机制打下基础。【方法】以季节性繁殖的阿勒泰羊和中国美利奴羊(军垦型)及常年繁殖的湖羊和小尾寒羊为研究对象,采用PCR-SSCP及测序技术检测MTNR1A基因ExonⅡT/C突变在4个绵羊品种群体中的分布情况,并分析其与绵羊季节性繁殖性状的关联性。【结果】MTNR1A基因ExonⅡT/C突变致使MTNR1A蛋白的胞内无规卷曲结构域...  (本文共5页) 阅读全文>>

《动物医学进展》2011年07期
动物医学进展

四个绵羊品种MHC-DQA1基因exonⅡ多态性分析

为了比较和揭示洼地绵羊、杜泊羊、小尾寒羊及特克赛尔绵羊4个绵羊品种MHC-DQA1基因的遗传多态性,采用PCR-RFLP技术对4个绵羊品种224个样本的MHC-DQA1基因exonⅡ的315 bp片段进行多态性分析;并对基因型频率和等位基因频率进行统计,运用Popgen32软件...  (本文共5页) 阅读全文>>

《中华微生物学和免疫学杂志》2004年02期
中华微生物学和免疫学杂志

汉、蒙古族人MBL基因ExonⅠ54位密码子点突变频率及其血浆含量相关性研究

目的 调查健康汉、蒙古族人甘露 (聚 )糖结合凝集素 (MBL)基因 5 4位密码子点突变的情况 ,测定健康汉、蒙古族人血浆MBL含量 ,并对健康汉、蒙古族人MBL基因 5 4位密码子点突变频率与其血浆MBL含量进行相关性分析。方法 PCR扩增 ,测定序列并建立MBL基因点突变检测方法 ,即PCR RFLP方法 (BanⅠ酶切 ) ;用ELISA法测血浆MBL含量。结果  (1)建立了MBLPCR方法 ,该方法特异性高 ,重复性好 ,最低检出量为 16 0pgDNA。 (2 )MBL的限制性内切酶BanⅠ酶切结果 :通过酶切电...  (本文共5页) 阅读全文>>

《新疆农业科学》2010年05期
新疆农业科学

牛双芽巴贝斯虫GST-HSP20(exon)融合蛋白间接ELISA检测方法的建立

【目的与方法】以纯化的牛双芽巴贝斯虫GST-HSP20(exons)融合蛋白作为检测抗原,通过优化ELISA反应条件,建立了检测牛双芽巴贝斯虫血清特异性抗体的新型间接ELISA方法。【结果】方阵试验确定的GST-HSP20抗原的最适包被浓度为5μg/mL,血清最佳稀释倍数为...  (本文共6页) 阅读全文>>