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苯丙烷生物合成基因簇参与水稻抗病性(英文)

Since colonising land, plants have undergone massive metabolic diversification. This is reflected by the numbers of metabolites that they collect  (本文共4页) 阅读全文>>

《中国抗生素杂志》2020年12期
中国抗生素杂志

链霉菌沉默生物合成基因簇调控的研究进展

本文以天蓝色链霉菌(Streptomyces coelicolor)中黄色色素coelimycin生...  (本文共7页) 阅读全文>>

《微生物学报》2017年11期
微生物学报

隐性次级代谢产物生物合成基因簇的激活及天然产物定向发现

传统的"活性-化合物"天然药物发现方法导致大量已知化合物被重复分离,大大加剧了新药发现的难度。规模化基因组测序揭示了微生物基因组中存在大量的隐性(cryptic)次级代谢产物生物合成基因簇,如何...  (本文共13页) 阅读全文>>

武汉大学
武汉大学

SpCas9酶切机制初探及其在生物合成基因簇克隆的应用

成簇规律间隔的短回文重复序列(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeat sequences, CRISPR)的相关蛋白(CRISPR-associated, Cas)Cas9,是一个RNA引导的核酸内切酶,其利用RNA与DNA间的碱基互补配对特异性识别并切割有合适原间隔区临近基序(protospacer adjacent motif, PAM)序列的双链DNA。当Cas9需要切割不同的靶标DNA时,只需要改变引导RNA中的20 nt(nucleotide)引导序列,这种可程序化设计和简便性使得CRISPR/Cas9技术已发展成一种重要的基因编辑工具,并已广泛应用于多种生物。作为目前应用最为广泛的来自于Streptococcus pyogenes的Cas9 (SpCas9),它特异性识别5’-NG1G2-3’的PAM序列。本研究首次发现在较高SpCas9浓度的...  (本文共151页) 本文目录 | 阅读全文>>

武汉大学
武汉大学

CRISPR/SpyCas9系统体外基因编辑的研究

近二十年来,由于对抗生素的滥用,越来越多的病原菌呈现出耐药性甚至多耐药性,人们如今已经发现几乎能耐受所有抗生素的超级细菌,然而新型有效抗生素的发掘和鉴定速度却日趋减缓。随着近十年基因组测序技术的飞速进步,越来越多的微生物基因组序列得到揭示,生物信息分析证明其中的绝大部分生物合成基因簇尚未得到充分挖掘,天然产物仍存在发现新的活性化合物的巨大潜力。体外克隆和编辑生物合成基因簇一方面可以避免原始菌株艰巨繁琐的遗传操作系统建立过程,另一方面有助于极大地推进无法在实验室条件下培养菌株或无法表达出目的化合物的基因簇的研究工作。因此该类技术对于充分挖掘生物合成基因簇潜力有着重要作用,同时对于新型高效的体外基因簇克隆和编辑工具的现实需要显得尤为迫切。成簇的规律间隔的短回文重复序列及相关蛋白(Clustered regularly interspaced short palindromic repeat/CRISPR-associated pro...  (本文共141页) 本文目录 | 阅读全文>>

南方医科大学
南方医科大学

赭曲霉全基因组测序和功能注释及其重要次级代谢产物生物合成基因簇的预测

Aspergillus westerdijkiae(赭曲霉)是隶属于曲霉属环绕组的一种丝状真菌。该霉菌因其产生的主要次级代谢产物——赭曲霉毒素A(ochratoxin A,OTA)具有强烈的肝脏和肾脏毒性以及潜在的致癌和致突变能力而受到全世界的广泛关注。研究发现,在玉米、小麦等粮食或饲料以及咖啡、啤酒和果汁饮料等食品产品中都能检测到A.westerdijkiae的存在及OTA的污染,严重危害人类健康及家畜安全。作为丝状真菌家族的一员,A.westerdijkiae的酶催化作用和次级代谢产物生物合成能力在工业生产和医药卫生领域也有极大的开发潜力。为了揭示A.westerdijkiae的病原性、潜在的酶降解能力以及其重要次级代谢产物OTA的生物合成机制,我们对A.westerdijkiae进行了全基因组测序和功能注释,并与其它8个已公开全基因组测序数据的曲霉属物种进行了全基因组比较分析。本研究中,我们测序和组装了大约36 MB的A....  (本文共105页) 本文目录 | 阅读全文>>