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一个基于Blast程序的多重序列对齐程序——Mblast

核酸序列和蛋白质序列的相似性分析日益成为生物信息学研究的核心内容 .NCBI的Blast程序是进行此类分析的最有力工具 .虽然它提供了初步的将多条序列进行综  (本文共4页) 阅读全文>>

《中国药科大学学报》2009年02期
中国药科大学学报

基于蛋白质结构的多重序列比对的黄金标准评估法:平均相似性法

目的:建立蛋白质多重序列的质量评估法。方法:假定在多重序列比对中的一条序列是未知的,以其他序列作为模板,通过将模板蛋白质的三维结构作为未知蛋...  (本文共3页) 阅读全文>>

西北农林科技大学
西北农林科技大学

流感病毒多重序列比对数据库构建与重配规律分析

流行性感冒病毒,简称流感病毒,是对人类危害最大的几种病毒之一,具有较高的致病率与致死率。流感病毒能够导致季节性流行性感冒,严重时能引发世界性的流感大流行。20世纪全球一共出现过3次世界性流感大流行(即1918年H1N1、1957年H2N2和1968年H3N2流感大流行)。此外,2009年墨西哥流感也是由甲型H1N1流感病毒引发的。为了减少流感疫情给人类带来的损失,人类已经在抗流感药物和疫苗方面投入了大量的人力和资金。同时,大规模流感病毒基因组测序工程和全球各大实验室已经产生了大量的流感病毒序列数据,人们可以越来越方便地获取流感病毒序列数据资源及其相关分析工具。对于许多研究分析而言,多重序列比对都是必不可少的。但由于各种技术原因,进行高精度成千上万条序列的多重序列比对是比较困难的。本研究利用邻接策略成功构建了手工编辑的流感病毒多重序列比对数据库,旨在覆盖全部公开序列数据,将多重序列比对问题转变为序列检索问题,从而进行快速、准确和大...  (本文共54页) 本文目录 | 阅读全文>>

《潍坊学院学报》2008年04期
潍坊学院学报

基于遗传算法和蚁群算法的多重序列比对

多重序列比对问题是复杂性较高的困难问题。基于蚁群算法的多重序列比对方法能够在合理的时间内找到得分接近参考比对的多序列比对解。但是,随着序...  (本文共3页) 阅读全文>>

《高技术通讯》2001年06期
高技术通讯

多重生物序列对准及其算法综述

多重序列对准作为一种结合优化方法的新方法 ,在研究生物体的功能、进化、序列和结构之间的内在联系方面正变得日趋...  (本文共7页) 阅读全文>>

《中山大学学报(自然科学版)》2005年02期
中山大学学报(自然科学版)

基于隐马尔可夫模型的多重序列分析

隐马尔可夫模型是最近几年在许多机器学习领域都得到成功应用的关于序列分析的重要统计模型,特别是在蛋白质家族的识别方面。这主要是由于生物...  (本文共5页) 阅读全文>>