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基于核rDNA的ITS及cpDNA的psbA-trnH序列的中国枣属植物的系统发育

枣属(Ziziphus Mill.)是鼠李科(Rhamnaceae)中最具经济价值的一个属。枣属的近代分类学研究可追溯到18世纪初,但一直以来在枣属分类问题上比较混乱,曾有40种,60种,100种等多种说法,枣属属下分类系统是否自然尚未可知。基于此,本研究对原产我国的枣属12种及一个外类群种,通过对核rDNA ITS序列及cpDNA的psbA-trnH序列直接测序法,在分子水平上重建枣属植物的系统发育。并对适合硅胶干燥的枣属植物叶片DNA的提取方法进行了比较。1.以硅胶干燥保存15天和半年的枣属植物叶片为试材,分别采用简易CTAB法、高盐沉淀法和高盐低pH法3种方法提取枣属总DNA,通过A_(260)/A_(280)和琼脂糖凝胶电泳对提取的总DNA进行鉴定。半年内不同保存时期提取的DNA没有差异;高盐沉淀法效果最好,所得DNA纯度高。2.枣属的ITS(包括5.8S)序列总长度为601~611bp,长度变异小,仅相差10bp,种间  (本文共65页) 本文目录 | 阅读全文>>

东北师范大学
东北师范大学

中国北方8种鸢尾属植物ITS序列分析及其分子系统学意义的研究

本文采用基因组DNA的PCR产物克隆测序对8种中国北方鸢尾属植物和外类群射干的核DNA的ITS序列(包括ITS1、5.8s rDNA和ITS2)进行测定,结果表明鸢尾属ITS序列总长度为551bp-670bp,ITS1与ITS2均有较大长度变异,ITS1长度为195bp-258bp,ITS2长度为192bp-251bp,平均遗传距离为0.203, ITS序列在鸢尾属内显示出较大的变异程度。用PHYLIP软件进行系统发育分析和分子钟检验,分别用NJ法、ML法和MP法构建系统树表明:鸢尾属植物ITS序列特别适合解决属内近源种间系统分类问题,在乌苏里鸢尾和黄菖蒲间关系及乌苏里鸢尾的分类地位问题,支持将乌苏里鸢尾降为亚种处理。对于鸢尾属ITS序列的进行系统发育分析时,ML法和MP法两种基于特征符的建树方法更容易得到一致的结果。LR法检验分子钟假说证明鸢尾属ITS序列拒绝分子钟假说。  (本文共39页) 本文目录 | 阅读全文>>

《江西农业学报》2020年03期
江西农业学报

通过ITS序列分析鉴定云南重楼内生真菌

采用组织分离法从云南重楼(Paris polyphylla var.yunnanensis)根、根状茎和叶3个部位的组织块中分离出内生真菌,并对这些内生真菌进行了传统形态学和分子生物学(ITS序列)鉴定。共分离到内生真菌26株,鉴...  (本文共6页) 阅读全文>>

《植物检疫》2020年02期
植物检疫

景天属多肉植物基于ITS条形码鉴定探析

在多个条形码基因研究的基础上,本研究以ITS序列为目的片段通过DNA条形码技术对口岸截获的景天属多肉植物进行快速鉴定。采用通用引物扩增景天属10种32个供试样本的ITS片段并双向测序拼接,利用M...  (本文共4页) 阅读全文>>

《北方农业学报》2020年01期
北方农业学报

内蒙古鄂尔多斯市野生羊肚菌ITS初步鉴定

【目的】探明内蒙古鄂尔多斯市野生羊肚菌的分布和种类。【方法】采用野生食用菌常用的鉴定方式——ITS测序对收集到的野生羊肚菌进行鉴定。【结果】鄂尔多斯市收集到的羊肚菌I...  (本文共4页) 阅读全文>>

《农业与技术》2019年20期
农业与技术

蓝玉簪龙胆ITS序列克隆与遗传分化分析

蓝玉簪龙胆为龙胆属的常见种之一,青藏高原特有物种。本研究通过对蓝玉簪龙胆6个个体进行ITS序列的克隆与测序,得到8条序列,长度为644~651bp,包含48个碱基突...  (本文共4页) 阅读全文>>