全部 学问词条 学问文献 基因富集分析 相关学问

在鉴定出差异表达基因后,一般会对差异表达基因进行功能富集分析。基因功能富集分析的目的是筛选出两组或多组(如代谢途径和功能分类)间表达水平有差异的基因集,即富集基因集。基因富集分析具有以下优点:①基因集按照统一的分类信息进行定... [详细]

《生物信息学》 字数(1657)

现阶段,基因测序技术主要基于高通量测序,其技术不断成熟的同时基因数据也大量产生。人类对基因的研究也不再集中于基因数据的获取上,重心开始逐渐偏移,着重探讨基因的功能及基因的多样性。当前面临的主要挑战在于解释和分析基因测序产生的大量数据,尝试从这些大量基因数据中挖掘出潜在的规律,为人...[详细]

哈尔滨工业大学 硕士论文 2016年 下载次数(421) | 被引次数(2)

目的探讨B细胞特异的莫洛尼白血病毒插入位点1基因(BMI1)在肝细胞癌(HCC)中表达上调及其与患者预后的关系。方法生物信息学分析BMI1与肝癌患者的临床资料及预后的关系。采用实时定量PCR检测HCC组织中BMI1表达情况,验证BMI1表达水平与患者临床病理学特征关系。从GEO数...[详细]

《局解手术学杂志》2019年06期 下载次数(209) | 被引次数(4)

目的总结原发性骨髓纤维化(primary myelofibrosis, PMF)的临床特征,分析PMF GSE26049、GSE84638、GSE124281基因表达谱中PMF信号传导通路。方法 25例PMF患者,收集其临床资料,并采用基因富集分析PMF GSE26049、GSE...[详细]

《中华实用诊断与治疗杂志》2020年06期 下载次数(171) | 被引次数(2)

目的分析TACC3mRNA在乳腺癌中的表达水平及其与预后的关系;探讨TACC3mRNA表达与乳腺癌患者临床资料的关系;运用GSEA基因富集分析方法预测TACC3所调控可能影响乳腺癌发展的基因集。方法登录GEO数据库下载并收集与乳腺癌相关的基因表达谱GSE42568及对应的临床信息...[详细]

《右江民族医学院学报》2020年04期 下载次数(152) | 被引次数(2)

目的探讨拓扑异构酶Ⅱα(TOP2A)mRNA在乳腺癌中的表达情况及其临床意义,并预测受TOP2A调控而影响乳腺癌发展的基因集。方法在基因表达汇编数据库中收集GSM42568表达谱数据及对应的临床信息,分析TOP2A mRNA在104例乳腺癌组织和17例正常乳腺组织间的表达情况,以...[详细]

《广西医学》2017年06期 下载次数(153) | 被引次数(3)

目的:研究先兆子痫(PE)及胎儿宫内发育迟缓(IUGR)致孕产妇及胎儿死亡的致病基因及相关通路。方法:利用加权基因共表达网络分析法(WGCNA)分析正常、PE、IUGR及PE&IUGR胎盘组织的基因测序数据集,寻找有意义的基因模块并构建共表达网络...[详细]

《武汉大学学报(医学版)》2022年02期 下载次数(238) | 被引次数(0)

目的利用计算机工具和已知的数据库进行挖掘和分析进而确定与白内障和抗氧化应激相关的基因集及信号通路,并进行白内障可能的有效治疗药物的预测和探索。方法利用文本挖掘工具pubmed2ensembl对白内障和抗氧化应激均相关的基因进行初步筛选,得到的基因集利用GeneC odis工具进行...[详细]

《眼科新进展》2019年01期 下载次数(292) | 被引次数(0)

如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_ana...[详细]

《生物信息学》2018年03期 下载次数(191) | 被引次数(0)

目的富集分析骨肉瘤相关基因,深层次挖掘基因信息,阐明骨肉瘤发病的基因机制。方法利用在线基因富集分析工具DAVID,针对(在线人类孟德尔遗传数据库)OMIM、系统分析基因功能(KEGG disease)、遗传协会数据库(Genetic...[详细]

《现代医药卫生》2013年06期 下载次数(409) | 被引次数(3)